ChemComp-UD0: (2S,3S,4R,5R,6R)-5-(acetylamino)-6-{[(S)-{[(S)-{[(2S,3R,4S,5R)-5-...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: UD0
• 名称: 名称: (2S,3S,4R,5R,6R)-5-(acetylamino)-6-{[(S)-{[(S)-{[(2S,3R,4S,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-3-hydroxy-4-{[(1E)-{3-hydroxy-2-methyl-5-[(phosphonooxy)methyl]pyridin-4-yl}methylidene]amino}tetrahydro-2H-pyran-2-carboxylic acid

Chemical information

組成

組成式: C₂₅H₃₄N₅O₂₂P₃ / 原子数: 89 / 化学式量: 849.479 / 形式電荷: 0

その他

3nub

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: UD0 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3NUB

履歴

作成	2010年7月13日
aromatic_flag"を修正	2011年6月4日
記述子を修正	2011年6月4日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=C1C=CN(C(=O)N1)C2OC(C(O)C2O)COP(=O)(OP(=O)(OC4OC(C(=O)O)C(O)C(/N=C/c3c(cnc(c3O)C)COP(=O)(O)O)C4NC(=O)C)O)O
• CACTVS 3.370: CC(=O)N[CH]1[CH](O[CH]([CH](O)[CH]1N=Cc2c(O)c(C)ncc2CO[P](O)(O)=O)C(O)=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[CH]3O[CH]([CH](O)[CH]3O)N4C=CC(=O)NC4=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.0: Cc1c(c(c(cn1)COP(=O)(O)O)C=NC2C(C(OC(C2O)C(=O)O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC3C(C(C(O3)N4C=CC(=O)NC4=O)O)O)NC(=O)C)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: CC(=O)N[C@H]1[C@H](O[C@@H]([C@@H](O)[C@@H]1N=Cc2c(O)c(C)ncc2CO[P](O)(O)=O)C(O)=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[C@@H]3O[C@H]([C@@H](O)[C@H]3O)N4C=CC(=O)NC4=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.0: Cc1c(c(c(cn1)COP(=O)(O)O)/C=N/[C@@H]2[C@H]([C@H](O[C@@H]([C@H]2O)C(=O)O)O[P@](=O)(O)O[P@@](=O)(O)OC[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@@H](O3)N4C=CC(=O)NC4=O)O)O)NC(=O)C)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C25H34N5O22P3/c1-9-17(33)12(11(5-26-9)7-47-53(40,41)42)6-27-15-16(28-10(2)31)24(50-21(19(15)35)23(37)38)51-55(45,46)52-54(43,44)48-8-13-18(34)20(36)22(49-13)30-4-3-14(32)29-25(30)39/h3-6,13,15-16,18-22,24,33-36H,7-8H2,1-2H3,(H,28,31)(H,37,38)(H,43,44)(H,45,46)(H,29,32,39)(H2,40,41,42)/b27-6+/t13-,15+,16+,18-,19-,20-,21-,22+,24+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: IGKBPIFLZAFLLV-VUZHIUKYSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: (2S,3S,4R,5R,6R)-5-(acetylamino)-6-{[(S)-{[(S)-{[(2S,3R,4S,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-3-hydroxy-4-{[(E)-{3-hydroxy-2-methyl-5-[(phosphonooxy)methyl]pyridin-4-yl}methylidene]amino}tetrahydro-2H-pyran-2-carboxylic acid
• OpenEye OEToolkits 1.7.0: (2S,3S,4R,5R,6R)-5-acetamido-6-[[[(2S,3R,4S,5R)-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-3-hydroxy-4-[(E)-[3-hydroxy-2-methyl-5-(phosphonooxymethyl)pyridin-4-yl]methylideneamino]oxane-2-carboxylic acid

PDBエントリ

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PDB-3nub:
WbpE, an Aminotransferase from Pseudomonas aeruginosa Involved in O-antigen Assembly in Complex with Product as the External Aldimine