ChemComp-U2S: 1-(5-deoxy-5-morpholin-4-yl-alpha-L-arabinofuranosyl)pyrimidine-2...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: U2S
• 名称: 名称: 1-(5-deoxy-5-morpholin-4-yl-alpha-L-arabinofuranosyl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione

Chemical information

組成

組成式: C₁₃H₁₉N₃O₆ / 原子数: 41 / 化学式量: 313.306 / 形式電荷: 0

その他

3d6p

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: U2S / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3D6P

履歴

作成	2008年6月10日
記述子を修正	2011年6月4日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / PubChem / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=C1NC(=O)N(C=C1)C2OC(C(O)C2O)CN3CCOCC3
• CACTVS 3.341: O[CH]1[CH](O)[CH](O[CH]1CN2CCOCC2)N3C=CC(=O)NC3=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1COCCN1CC2C(C(C(O2)N3C=CC(=O)NC3=O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O[C@H]1CN2CCOCC2)N3C=CC(=O)NC3=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1COCCN1C[C@H]2[C@@H]([C@H]([C@@H](O2)N3C=CC(=O)NC3=O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C13H19N3O6/c17-9-1-2-16(13(20)14-9)12-11(19)10(18)8(22-12)7-15-3-5-21-6-4-15/h1-2,8,10-12,18-19H,3-7H2,(H,14,17,20)/t8-,10-,11+,12+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: LZYQLCIKQTYBER-OHBODLIOSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: 1-(5-deoxy-5-morpholin-4-yl-alpha-L-arabinofuranosyl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: 1-[(2R,3R,4R,5S)-3,4-dihydroxy-5-(morpholin-4-ylmethyl)oxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione

PDBエントリ

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PDB-3d6p:
RNase A- 5'-Deoxy-5'-N-morpholinouridine complex