ChemComp-TOI: (1~{R},2~{S},5~{S},6~{S})-2-[(1~{S})-1-[3-[(4-azanylidene-2-methy...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: TOI
• 名称: 名称: (1~{R},2~{S},5~{S},6~{S})-2-[(1~{S})-1-[3-[(4-azanylidene-2-methyl-1~{H}-pyrimidin-5-yl)methyl]-4-methyl-5-[2-[oxidanyl; 別称: ThDP, decarboxylated 2-oxoglutarate and isochorismate adduct, covalent intermediate II

Chemical information

組成

組成式: C₂₆H₃₅N₄O₁₆P₂S / 原子数: 84 / 化学式量: 753.586 / 形式電荷: 1

その他

5esu

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: TOI / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 5ESU

履歴

作成	2015年11月17日
公開	2016年6月22日
Modify synonyms	2020年6月5日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / PubChem / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• CACTVS 3.385: CC1=NC(=N)C(=CN1)C[n+]2c(C)c(CCO[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)sc2[C](O)(CCC(O)=O)[CH]3C=C[CH](OC(=C)C(O)=O)[CH](O)[CH]3C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 2.0.4: Cc1c(sc([n+]1CC2=CNC(=NC2=N)C)C(CCC(=O)O)(C3C=CC(C(C3C(=O)O)O)OC(=C)C(=O)O)O)CCOP(=O)(O)OP(=O)(O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: CC1=NC(=N)C(=CN1)C[n+]2c(C)c(CCO[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)sc2[C@](O)(CCC(O)=O)[C@H]3C=C[C@H](OC(=C)C(O)=O)[C@@H](O)[C@@H]3C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 2.0.4: [H]/N=C/1\C(=CNC(=N1)C)C[n+]2c(c(sc2[C@](CCC(=O)O)([C@H]3C=C[C@@H]([C@H]([C@@H]3C(=O)O)O)OC(=C)C(=O)O)O)CCOP(=O)(O)OP(=O)(O)O)C

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C26H34N4O16P2S/c1-12-18(7-9-44-48(42,43)46-47(39,40)41)49-25(30(12)11-15-10-28-14(3)29-22(15)27)26(38,8-6-19(31)32)16-4-5-17(45-13(2)23(34)35)21(33)20(16)24(36)37/h4-5,10,16-17,20-21,33,38H,2,6-9,11H2,1,3H3,(H7-,27,28,29,31,32,34,35,36,37,39,40,41,42,43)/p+1/t16-,17-,20+,21+,26-/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: AJVZCJMDQDMTBE-BLORIJLWSA-O

PDBエントリ

全2件を表示しています

PDB-5esu:
Crystal Structure of M. tuberculosis MenD bound to Mg2+ and Covalent Intermediate II (a ThDP + de-carboxylated 2-oxoglutarate + Isochorismate adduct)

PDB-6o04:
M.tb MenD IntII bound with Inhibitor