ChemComp-TBD: 2*-DEOXY-THYMIDINE-5*-ALPHA BORANO DIPHOSPHATE (ISOMER RP)

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: TBD
• 名称: 名称: 2*-deoxy-thymidine-5*-alpha borano diphosphate (isomer rp)

Chemical information

組成

組成式: C₁₀H₁₉BN₂O₁₀P₂ / 原子数: 44 / 化学式量: 400.024 / 形式電荷: 0

その他

1f6t

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: TBD / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 1F6T

履歴

作成	2000年9月6日
記述子を修正	2011年6月4日
記述子を修正	2012年1月5日
座標を修正	2012年1月5日

• 外部リンク: UniChem / ZINC / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=P(O)(O)O[P+](O)(OCC2OC(N1C(=O)NC(=O)C(=C1)C)CC2O)[BH3-]
• CACTVS 3.385: [BH3-][P+](O)(OC[CH]1O[CH](C[CH]1O)N2C=C(C)C(=O)NC2=O)O[P](O)(O)=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.5: [BH3-][P+](O)(OCC1C(CC(O1)N2C=C(C(=O)NC2=O)C)O)OP(=O)(O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: [BH3-][P@@+](O)(OC[C@H]1O[C@H](C[C@@H]1O)N2C=C(C)C(=O)NC2=O)O[P](O)(O)=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.5: [BH3-][P@@+](O)(OC[C@@H]1[C@H](C[C@@H](O1)N2C=C(C(=O)NC2=O)C)O)OP(=O)(O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C10H19BN2O10P2/c1-5-3-13(10(16)12-9(5)15)8-2-6(14)7(22-8)4-21-24(11,17)23-25(18,19)20/h3,6-8,14,17H,2,4H2,1,11H3,(H,12,15,16)(H2,18,19,20)/t6-,7+,8+,24+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: QDZZFSSDQOLCBV-TYNZIUOXSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: trihydrido{5'-O-[(1R)-1,3,3-trihydroxy-3-oxidodiphosphoxanyl-kappaP~1~]thymidine}boron
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: trihydrido-[(R)-hydroxy-[[(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxo-pyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy]-phosphonooxy-phosphaniumyl]boron

PDBエントリ

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PDB-1f6t:
STRUCTURE OF THE NUCLEOSIDE DIPHOSPHATE KINASE/ALPHA-BORANO(RP)-TDP.MG COMPLEX