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万見

- ChemComp-SV6: (1S,3aR,6aS)-2-[(2S)-2-({(2S)-2-cyclohexyl-2-[(pyrazin-2-ylcarbon... -

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基本情報

登録情報	データベース: PDB化学物質要素 / ID: SV6
名称	名称: (1S,3aR,6aS)-2-[(2S)-2-({(2S)-2-cyclohexyl-2-[(pyrazin-2-ylcarbonyl)amino]acetyl}amino)-3,3-dimethylbutanoyl]-N-[(2R,3S)-1-(cyclopropylamino)-2-hydroxy-1-oxohexan-3-yl]octahydrocyclopenta[c]pyrrole-1-carboxamide 別称: TELAPREVIR, bound form

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BIRD information

タイプ	ペプチド様 / Antiviral
ダウンロード	Molecular definition / Chemical definition

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Chemical information

組成

組成式: C₃₆H₅₅N₇O₆ / 原子数: 104 / 化学式量: 681.865 / 形式電荷: 0

その他

タイプ: PEPTIDE-LIKE / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: SV6 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3SV6 / 子要素: VGL, CHG, TBG, 037, 03A

履歴

作成	2011年8月8日
Modify synonyms	2011年8月10日
Modify synonyms	2011年9月19日
公開	2012年8月31日
Modify synonyms	2021年3月13日

外部リンク

Wikipedia search /

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構造の表示

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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詳細

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SMILES

ACDLabs 12.01	O=C(NC1CC1)C(O)C(NC(=O)C4N(C(=O)C(NC(=O)C(NC(=O)c2nccnc2)C3CCCCC3)C(C)(C)C)CC5CCCC45)CCC
CACTVS 3.370	CCC[CH](NC(=O)[CH]1[CH]2CCC[CH]2CN1C(=O)[CH](NC(=O)[CH](NC(=O)c3cnccn3)C4CCCCC4)C(C)(C)C)[CH](O)C(=O)NC5CC5
OpenEye OEToolkits 1.7.2	CCCC(C(C(=O)NC1CC1)O)NC(=O)C2C3CCCC3CN2C(=O)C(C(C)(C)C)NC(=O)C(C4CCCCC4)NC(=O)c5cnccn5

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SMILES CANONICAL

CACTVS 3.370	CCC[C@H](NC(=O)[C@@H]1[C@H]2CCC[C@H]2CN1C(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)c3cnccn3)C4CCCCC4)C(C)(C)C)[C@@H](O)C(=O)NC5CC5
OpenEye OEToolkits 1.7.2	CCC[C@@H]([C@H](C(=O)NC1CC1)O)NC(=O)[C@@H]2[C@H]3CCC[C@H]3CN2C(=O)[C@H](C(C)(C)C)NC(=O)[C@H](C4CCCCC4)NC(=O)c5cnccn5

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InChI

InChI 1.03	InChI=1S/C36H55N7O6/c1-5-10-25(29(44)34(48)39-23-15-16-23)40-33(47)28-24-14-9-13-22(24)20-43(28)35(49)30(36(2,3)4)42-32(46)27(21-11-7-6-8-12-21)41-31(45)26-19-37-17-18-38-26/h17-19,21-25,27-30,44H,5-16,20H2,1-4H3,(H,39,48)(H,40,47)(H,41,45)(H,42,46)/t22-,24-,25-,27-,28-,29+,30+/m0/s1

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InChIKey

InChI 1.03	FTZGWEAUHOMNIG-FJRGXGLZSA-N

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SYSTEMATIC NAME

ACDLabs 12.01	(1S,3aR,6aS)-2-[(2S)-2-({(2S)-2-cyclohexyl-2-[(pyrazin-2-ylcarbonyl)amino]acetyl}amino)-3,3-dimethylbutanoyl]-N-[(2R,3S)-1-(cyclopropylamino)-2-hydroxy-1-oxohexan-3-yl]octahydrocyclopenta[c]pyrrole-1-carboxamide (non-preferred name)
OpenEye OEToolkits 1.7.2	(3S,3aS,6aR)-2-[(2S)-2-[[(2S)-2-cyclohexyl-2-(pyrazin-2-ylcarbonylamino)ethanoyl]amino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-N-[(2R,3S)-1-(cyclopropylamino)-2-oxidanyl-1-oxidanylidene-hexan-3-yl]-3,3a,4,5,6,6a-hexahydro-1H-cyclopenta[c]pyrrole-3-carboxamide

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PDBエントリ

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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