ChemComp-SPU: 2-{[(R)-{[(2S,3R,4E)-2-amino-3-hydroxyoctadec-4-en-1-yl]oxy}(hydr...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: SPU
• 名称: 名称: 2-{[(R)-{[(2S,3R,4E)-2-amino-3-hydroxyoctadec-4-en-1-yl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-N,N,N-trimethylethanaminium; 別称: sphingosylphosphorylcholine, sphingosine phosphorylcholine; 日化辞名称: スフィンゴシルホスホリルコリン

Chemical information

組成

組成式: C₂₃H₅₀N₂O₅P / 原子数: 81 / 化学式量: 465.627 / 形式電荷: 1

その他

3if7

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: SPU / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3IF7

履歴

作成	2009年7月28日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2020年6月5日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / ChEBI / ChEMBL / HMDB / KEGG_Ligand / NMRShiftDB / 日化辞 / PubChem / Rhea / SureChEMBL / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 11.02: O=P(OCC(N)C(O)/C=C/CCCCCCCCCCCCC)(OCC[N+](C)(C)C)O
• CACTVS 3.352: CCCCCCCCCCCCCC=C[CH](O)[CH](N)CO[P](O)(=O)OCC[N+](C)(C)C
• OpenEye OEToolkits 1.7.0: CCCCCCCCCCCCCC=CC(C(COP(=O)(O)OCC[N+](C)(C)C)N)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.352: CCCCCCCCCCCCC\C=C\[C@@H](O)[C@@H](N)CO[P](O)(=O)OCC[N+](C)(C)C
• OpenEye OEToolkits 1.7.0: CCCCCCCCCCCCC/C=C/[C@H]([C@H](CO[P@](=O)(O)OCC[N+](C)(C)C)N)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C23H49N2O5P/c1-5-6-7-8-9-10-11-12-13-14-15-16-17-18-23(26)22(24)21-30-31(27,28)29-20-19-25(2,3)4/h17-18,22-23,26H,5-16,19-21,24H2,1-4H3/p+1/b18-17+/t22-,23+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: JLVSPVFPBBFMBE-HXSWCURESA-O

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 11.02: 2-{[(R)-{[(2S,3R,4E)-2-amino-3-hydroxyoctadec-4-en-1-yl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-N,N,N-trimethylethanaminium
• OpenEye OEToolkits 1.6.1: 2-[[(E,2S,3R)-2-azanyl-3-hydroxy-octadec-4-enoxy]-hydroxy-phosphoryl]oxyethyl-trimethyl-azanium

PDBエントリ

全2件を表示しています

PDB-3if7:
Structure of Calmodulin complexed with its first endogenous inhibitor, sphingosylphosphorylcholine

PDB-4nt2:
Crystal structure of Arabidopsis ACD11 (accelerated-cell-death 11) complexed with lyso-sphingomyelin (d18:1) at 2.4 Angstrom resolution