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基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDH92 |
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![]() | Plasmodium falciparum lipocalin: Dimer-tetramer equilibrium through a concentration series (combined batch and SEC-SAXS measurements)
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機能・相同性 | Calycin / Parasitophorous vacuolar protein 5, putative![]() |
生物種 | ![]() ![]() |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #3920 | ![]() タイプ: atomic / 対称性: P222 コメント: Tetramer model: volume fractions @ 10, 5, 2, & 1 mg/ml: 0.78, 0.66, 0.44, 0.24 (0.15 from SEC) カイ2乗値: 1.27 / P-value: 0.005535 |
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モデル #3921 | ![]() タイプ: atomic / 対称性: P2 コメント: Dimer model: volume fractions @ 10, 5, 2, & 1 mg/ml: 0.22, 0.34, 0.56, 0.76 (0.85 from SEC) カイ2乗値: 1.27 / P-value: 0.005535 |
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試料
![]() | 名称: Plasmodium falciparum lipocalin: Dimer-tetramer equilibrium through a concentration series (combined batch and SEC-SAXS measurements) 試料濃度: 10 mg/ml |
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バッファ | 名称: 20 mM Tris pH7.5, 150 mM NaCl, 5% v/v glycerol / pH: 7.5 |
要素 #1964 | 名称: PfLipocalin / タイプ: protein / 記述: Plasmodium falciparum Lipocalin / 分子量: 22.223 / 分子数: 4 / 由来: Plasmodium falciparum (isolate 3D7) / 参照: UniProt: Q8I2Q0 配列: PGNDNNNVNN DGVVHVLSKN IDVKNLQGTF YEIATNASDK IFPGLACRCT KYEFSGLKRD GNLGYVLINF SCARNFIFGE KKSEMTFKLI LNKPLDENTT TVEEFNASIY LVQGNQQILL NGNINIIYAE LNEQNEFEHL ILGGQKSIEP MIIMSKYRTV LLDTYNKLIN ...配列: PGNDNNNVNN DGVVHVLSKN IDVKNLQGTF YEIATNASDK IFPGLACRCT KYEFSGLKRD GNLGYVLINF SCARNFIFGE KKSEMTFKLI LNKPLDENTT TVEEFNASIY LVQGNQQILL NGNINIIYAE LNEQNEFEHL ILGGQKSIEP MIIMSKYRTV LLDTYNKLIN SLYLAGYEPS LLTWPFIIQT DQTFCD |
-実験情報
ビーム | 設備名称: PETRA III EMBL P12 / 地域: Hamburg / 国: Germany ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: Pilatus 6M | ||||||||||||||||||||||||||||||
スキャン | 測定日: 2019年4月8日 / 保管温度: 20 °C / セル温度: 10 °C / 照射時間: 0.05 sec. / フレーム数: 20 / 単位: 1/nm /
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距離分布関数 P(R) |
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結果 | コメント: The models displayed in this entry fit the concentration series and SEC-SAXS data as a concentration-dependent tetramer-dimer equilibrium. The volume fraction of the tetramer decreases ...コメント: The models displayed in this entry fit the concentration series and SEC-SAXS data as a concentration-dependent tetramer-dimer equilibrium. The volume fraction of the tetramer decreases systematically as the sample concentration ins decreased, or via dilution through the SEC column (evaluated using SASREFmx in P222 (tetramer) P2 (dimer) symmery). The volume fractions of tetramer are: 10 mg/ml, 0.78; 5 mg/ml, 0.66; 2 mg/ml, 0.44; 1 mg/ml, 0.24 and for SEC, 0.15. Additional SASREFmx models, and their associated volume fractions (that do not differ significantly to the models and volume fractions reported here) are included in the full-entry zip archive.
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