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基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDGZ9 |
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![]() | Protein Disulfide Isomerase (PDI) purified from bovine liver
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機能・相同性 | ![]() procollagen-proline 4-dioxygenase activity / protein disulfide-isomerase / peptidyl-proline hydroxylation to 4-hydroxy-L-proline / protein disulfide isomerase activity / response to endoplasmic reticulum stress / melanosome / protein folding / protein heterodimerization activity / endoplasmic reticulum lumen / external side of plasma membrane / endoplasmic reticulum 類似検索 - 分子機能 |
生物種 | ![]() ![]() |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #3863 | ![]() タイプ: dummy / ソフトウェア: (dammif (r7883)) / ダミー原子の半径: 3.50 A / 対称性: P1 / カイ2乗値: 1.296 / P-value: 0.050249 |
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モデル #3874 | ![]() タイプ: dummy / ダミー原子の半径: 3.50 A / 対称性: P1 / カイ2乗値: 1.296 / P-value: 0.050249 |
モデル #3872 | ![]() タイプ: dummy / ソフトウェア: (dammif (r7883)) / ダミー原子の半径: 3.50 A / 対称性: P1 / カイ2乗値: 1.304 / P-value: 0.050249 |
モデル #3875 | ![]() タイプ: dummy / ダミー原子の半径: 3.50 A / 対称性: P1 / カイ2乗値: 1.304 / P-value: 0.050249 |
モデル #3876 | ![]() タイプ: dummy / ソフトウェア: (DAMFILT 5.0 (r7883)) / ダミー原子の半径: 2.50 A / 対称性: P1 / カイ2乗値: 1.307 / P-value: 0.050249 |
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試料
![]() | 名称: Protein Disulfide Isomerase (PDI) purified from bovine liver 試料濃度: 2.50-10.00 |
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バッファ | 名称: 50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl / pH: 7.5 コメント: PDI was incubated with 0.5mM TCEP to reduce the Active sites one hour before SAXS data collection |
要素 #1937 | 名称: PDI / タイプ: protein / 記述: Protein disulfide-isomerase / 分子量: 57.265 / 分子数: 1 / 由来: Bos taurus / 参照: UniProt: P05307 配列: MLRRALLCLA LTALFRAGAG APDEEDHVLV LHKGNFDEAL AAHKYLLVEF YAPWCGHCKA LAPEYAKAAG KLKAEGSEIR LAKVDATEES DLAQQYGVRG YPTIKFFKNG DTASPKEYTA GREADDIVNW LKKRTGPAAS TLSDGAAAEA LVESSEVAVI GFFKDMESDS ...配列: MLRRALLCLA LTALFRAGAG APDEEDHVLV LHKGNFDEAL AAHKYLLVEF YAPWCGHCKA LAPEYAKAAG KLKAEGSEIR LAKVDATEES DLAQQYGVRG YPTIKFFKNG DTASPKEYTA GREADDIVNW LKKRTGPAAS TLSDGAAAEA LVESSEVAVI GFFKDMESDS AKQFFLAAEV IDDIPFGITS NSDVFSKYQL DKDGVVLFKK FDEGRNNFEG EVTKEKLLDF IKHNQLPLVI EFTEQTAPKI FGGEIKTHIL LFLPKSVSDY EGKLSNFKKA AESFKGKILF IFIDSDHTDN QRILEFFGLK KEECPAVRLI TLEEEMTKYK PESDELTAEK ITEFCHRFLE GKIKPHLMSQ ELPDDWDKQP VKVLVGKNFE EVAFDEKKNV FVEFYAPWCG HCKQLAPIWD KLGETYKDHE NIVIAKMDST ANEVEAVKVH SFPTLKFFPA SADRTVIDYN GERTLDGFKK FLESGGQDGA GDDDDLEDLE EAEEPDLEED DDQKAVKDEL |
-実験情報
ビーム | 設備名称: Advanced Photon Source (APS), Argonne National Laboratory BioCAT 18ID 地域: Lemont, IL / 国: USA ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: Pilatus3 X 1M / Pixsize x: 0.172 mm | |||||||||||||||||||||||||||||||||
スキャン | 測定日: 2015年11月4日 / 保管温度: 10 °C / セル温度: 10 °C / 照射時間: 1 sec. / フレーム数: 8 / 単位: 1/A /
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距離分布関数 P(R) |
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結果 | コメント: PDI was purified from bovine liver and was incubated with 0.5mM TCEP to reduce the active sites one hour before SAXS data collection.
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