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-基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDGX9 |
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試料 | Nucleolar RNA helicase 2 (DDX21) fragment 186-620
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機能・相同性 | 機能・相同性情報 RNA polymerase inhibitor activity / 7SK snRNA binding / R-loop processing / positive regulation of myeloid dendritic cell cytokine production / B-WICH complex / miRNA binding / negative regulation of transcription by RNA polymerase I / positive regulation of transcription by RNA polymerase III / snoRNA binding / positive regulation of transcription by RNA polymerase I ...RNA polymerase inhibitor activity / 7SK snRNA binding / R-loop processing / positive regulation of myeloid dendritic cell cytokine production / B-WICH complex / miRNA binding / negative regulation of transcription by RNA polymerase I / positive regulation of transcription by RNA polymerase III / snoRNA binding / positive regulation of transcription by RNA polymerase I / response to exogenous dsRNA / Major pathway of rRNA processing in the nucleolus and cytosol / B-WICH complex positively regulates rRNA expression / osteoblast differentiation / rRNA processing / double-stranded RNA binding / chromosome / defense response to virus / positive regulation of canonical NF-kappaB signal transduction / transcription by RNA polymerase II / RNA helicase activity / rRNA binding / RNA helicase / chromatin remodeling / innate immune response / mRNA binding / nucleolus / positive regulation of transcription by RNA polymerase II / ATP hydrolysis activity / mitochondrion / RNA binding / nucleoplasm / ATP binding / identical protein binding / membrane / cytosol 類似検索 - 分子機能 |
生物種 | Homo sapiens (ヒト) |
登録者 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #2926 | タイプ: dummy / ソフトウェア: (r10552) / ダミー原子の半径: 2.50 A / 対称性: P1 / カイ2乗値: 1.071 / P-value: 0.317391 |
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-試料
試料 | 名称: Nucleolar RNA helicase 2 (DDX21) fragment 186-620 / 試料濃度: 10 mg/ml |
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バッファ | 名称: 20 mM HEPES, 500 mM NaCl, 10 % Glycerol, 2 mM TCEP / pH: 7.5 |
要素 #1349 | 名称: DDX21-186-620 / タイプ: protein / 記述: Nucleolar RNA helicase 2 fragment 186-620 / 分子量: 49.034 / 分子数: 2 / 由来: Homo sapiens / 参照: UniProt: Q9NR30 配列: MGAFSNFPIS EETIKLLKGR GVTFLFPIQA KTFHHVYSGK DLIAQARTGT GKTFSFAIPL IEKLHGELQD RKRGRAPQVL VLAPTRELAN QVSKDFSDIT KKLSVACFYG GTPYGGQFER MRNGIDILVG TPGRIKDHIQ NGKLDLTKLK HVVLDEVDQM LDMGFADQVE ...配列: MGAFSNFPIS EETIKLLKGR GVTFLFPIQA KTFHHVYSGK DLIAQARTGT GKTFSFAIPL IEKLHGELQD RKRGRAPQVL VLAPTRELAN QVSKDFSDIT KKLSVACFYG GTPYGGQFER MRNGIDILVG TPGRIKDHIQ NGKLDLTKLK HVVLDEVDQM LDMGFADQVE EILSVAYKKD SEDNPQTLLF SATCPHWVFN VAKKYMKSTY EQVDLIGKKT QKTAITVEHL AIKCHWTQRA AVIGDVIRVY SGHQGRTIIF CETKKEAQEL SQNSAIKQDA QSLHGDIPQK QREITLKGFR NGSFGVLVAT NVAARGLDIP EVDLVIQSSP PKDVESYIHR SGRTGRAGRT GVCICFYQHK EEYQLVQVEQ KAGIKFKRIG VPSATEIIKA SSKDAIRLLD SVPPTAISHF KQSAEKLIEE KGAVEALAAA LAHISGHHHH HH |
-実験情報
ビーム | 設備名称: ESRF BM29 / 地域: Grenoble / 国: France / 線源: X-ray synchrotron / 波長: 0.099 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 2.867 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: Pilatus 1M / タイプ: Dectris / Pixsize x: 172 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||
スキャン | タイトル: Nucleolar RNA helicase 2 (DDX21) fragment 186-620 測定日: 2018年3月4日 / セル温度: 20 °C / 照射時間: 1 sec. / フレーム数: 3000 / 単位: 1/A /
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距離分布関数 P(R) | ソフトウェア P(R): GNOM 5.0 / ポイント数: 787 /
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結果 | カーブのタイプ: sec /
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