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-基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDGU9 |
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試料 | Nucleolar RNA helicase 2 (DDX21-FL)
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機能・相同性 | 機能・相同性情報 RNA polymerase inhibitor activity / 7SK snRNA binding / R-loop processing / positive regulation of myeloid dendritic cell cytokine production / B-WICH complex / miRNA binding / positive regulation of transcription by RNA polymerase III / negative regulation of transcription by RNA polymerase I / snoRNA binding / positive regulation of transcription by RNA polymerase I ...RNA polymerase inhibitor activity / 7SK snRNA binding / R-loop processing / positive regulation of myeloid dendritic cell cytokine production / B-WICH complex / miRNA binding / positive regulation of transcription by RNA polymerase III / negative regulation of transcription by RNA polymerase I / snoRNA binding / positive regulation of transcription by RNA polymerase I / response to exogenous dsRNA / Major pathway of rRNA processing in the nucleolus and cytosol / B-WICH complex positively regulates rRNA expression / osteoblast differentiation / rRNA processing / chromosome / double-stranded RNA binding / positive regulation of canonical NF-kappaB signal transduction / defense response to virus / transcription by RNA polymerase II / RNA helicase activity / chromatin remodeling / rRNA binding / RNA helicase / innate immune response / mRNA binding / nucleolus / positive regulation of transcription by RNA polymerase II / ATP hydrolysis activity / mitochondrion / RNA binding / nucleoplasm / ATP binding / identical protein binding / membrane / cytosol 類似検索 - 分子機能 |
生物種 | Homo sapiens (ヒト) |
登録者 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #2551 | タイプ: dummy / ソフトウェア: (r9988) / ダミー原子の半径: 2.10 A / 対称性: P1 / カイ2乗値: 1.093 / P-value: 0.091176 |
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-試料
試料 | 名称: Nucleolar RNA helicase 2 (DDX21-FL) / 試料濃度: 10 mg/ml |
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バッファ | 名称: 20 mM HEPES, 500 mM NaCl, 10 % Glycerol, 2 mM TCEP / pH: 7.5 |
要素 #1324 | 名称: DDX21 / タイプ: protein / 記述: Nucleolar RNA helicase 2 / 分子量: 90.993 / 分子数: 2 / 由来: Homo sapiens / 参照: UniProt: Q9NR30 配列: GSGMKETAAA KFERQHMDSP DLGTDDDDKA MADIGSPGKL RSDAGLESDT AMKKGETLRK QTEEKEKKEK PKSDKTEEIA EEEETVFPKA KQVKKKAEPS EVDMNSPKSK KAKKKEEPSQ NDISPKTKSL RKKKEPIEKK VVSSKTKKVT KNEEPSEEEI DAPKPKKMKK ...配列: GSGMKETAAA KFERQHMDSP DLGTDDDDKA MADIGSPGKL RSDAGLESDT AMKKGETLRK QTEEKEKKEK PKSDKTEEIA EEEETVFPKA KQVKKKAEPS EVDMNSPKSK KAKKKEEPSQ NDISPKTKSL RKKKEPIEKK VVSSKTKKVT KNEEPSEEEI DAPKPKKMKK EKEMNGETRE KSPKLKNGFP HPEPDCNPSE AASEESNSEI EQEIPVEQKE GAFSNFPISE ETIKLLKGRG VTFLFPIQAK TFHHVYSGKD LIAQARTGTG KTFSFAIPLI EKLHGELQDR KRGRAPQVLV LAPTRELANQ VSKDFSDITK KLSVACFYGG TPYGGQFERM RNGIDILVGT PGRIKDHIQN GKLDLTKLKH VVLDEVDQML DMGFADQVEE ILSVAYKKDS EDNPQTLLFS ATCPHWVFNV AKKYMKSTYE QVDLIGKKTQ KTAITVEHLA IKCHWTQRAA VIGDVIRVYS GHQGRTIIFC ETKKEAQELS QNSAIKQDAQ SLHGDIPQKQ REITLKGFRN GSFGVLVATN VAARGLDIPE VDLVIQSSPP KDVESYIHRS GRTGRAGRTG VCICFYQHKE EYQLVQVEQK AGIKFKRIGV PSATEIIKAS SKDAIRLLDS VPPTAISHFK QSAEKLIEEK GAVEALAAAL AHISGATSVD QRSLINSNVG FVTMILQCSI EMPNISYAWK ELKEQLGEEI DSKVKGMVFL KGKLGVCFDV PTASVTEIQE KWHDSRRWQL SVATEQPELE GPREGYGGFR GQREGSRGFR GQRDGNRRFR GQREGSRGPR GQRSGGGNKS NRSQNKGQKR SFSKAFGQ |
-実験情報
ビーム | 設備名称: ESRF BM29 / 地域: Grenoble / 国: France / 線源: X-ray synchrotron / 波長: 0.099 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 2.867 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: Pilatus 1M / タイプ: Dectris / Pixsize x: 172 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||
スキャン | タイトル: Nucleolar RNA helicase 2 (DDX21-FL) / 測定日: 2017年11月25日 / セル温度: 20 °C / 照射時間: 1 sec. / フレーム数: 3000 / 単位: 1/A /
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距離分布関数 P(R) | ソフトウェア P(R): GNOM 5.0 / ポイント数: 793 /
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結果 | カーブのタイプ: sec /
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