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-基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDFY3 |
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試料 | Semi-synthetic nucleosome core particle (NCP) in complex with lysine-specific demethylase (LSD2) and the dehydrogenase domain plus linker of cytokine-like nuclear factor (NPAC delta-205)
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生物種 | Homo sapiens (ヒト) Xenopus laevis (アフリカツメガエル) synthetic construct (人工物) |
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-Data source
SASBDBのページ | SASDFY3 |
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-モデル
-試料
試料 | 名称: Semi-synthetic nucleosome core particle (NCP) in complex with lysine-specific demethylase (LSD2) and the dehydrogenase domain plus linker of cytokine-like nuclear factor (NPAC delta-205) 試料濃度: 1.8 mg/ml / Entity id: 1516 / 1519 / 1520 / 1521 / 1522 / 1523 / 1524 |
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バッファ | 名称: 15 mM HEPES, 200 mM NaCl / pH: 7.3 |
要素 #1516 | 名称: LSD2 / タイプ: protein / 記述: Lysyne-specific Demethylase LSD2 / 分子量: 88.832 / 分子数: 1 / 由来: Homo sapiens 配列: KKKATETTDE DEDGGSEKKY RKCEKAGCTA TCPVCFASAS ERCAKNGYTS RWYHLSCGEH FCNECFDHYY RSHKDGYDKY TTWKKIWTSN GKTEPSPKAF MADQQLPYWV QCTKPECRKW RQLTKEIQLT PQIAKTYRCG MKPNTAIKPE TSDHCSLPED LRVLEVSNHW ...配列: KKKATETTDE DEDGGSEKKY RKCEKAGCTA TCPVCFASAS ERCAKNGYTS RWYHLSCGEH FCNECFDHYY RSHKDGYDKY TTWKKIWTSN GKTEPSPKAF MADQQLPYWV QCTKPECRKW RQLTKEIQLT PQIAKTYRCG MKPNTAIKPE TSDHCSLPED LRVLEVSNHW WYSMLILPPL LKDSVAAPLL SAYYPDCVGM SPSCTSTNRA AATGNASPGK LEHSKAALSV HVPGMNRYFQ PFYQPNECGK ALCVRPDVME LDELYEFPEY SRDPTMYLAL RNLILALWYT NCKEALTPQK CIPHIIVRGL VRIRCVQEVE RILYFMTRKG LINTGVLSVG ADQYLLPKDY HNKSVIIIGA GPAGLAAARQ LHNFGIKVTV LEAKDRIGGR VWDDKSFKGV TVGRGAQIVN GCINNPVALM CEQLGISMHK FGERCDLIQE GGRITDPTID KRMDFHFNAL LDVVSEWRKD KTQLQDVPLG EKIEEIYKAF IKESGIQFSE LEGQVLQFHL SNLEYACGSN LHQVSARSWD HNEFFAQFAG DHTLLTPGYS VIIEKLAEGL DIQLKSPVQC IDYSGDEVQV TTTDGTGYSA QKVLVTVPLA LLQKGAIQFN PPLSEKKMKA INSLGAGIIE KIALQFPYRF WDSKVQGADF FGHVPPSASK RGLFAVFYDM DPQKKHSVLM SVIAGEAVAS VRTLDDKQVL QQCMATLREL FKEQEVPDPT KYFVTRWSTD PWIQMAYSFV KTGGSGEAYD IIAEDIQGTV FFAGEATNRH FPQTVTGAYL SGVREASKIA AF |
要素 #1519 | 名称: NPAC delta205 / タイプ: protein / 記述: NPAC linker+DH (delta-205) / 分子量: 37.438 / 分子数: 4 / 由来: Homo sapiens 配列: TASEPVKDAD PHFHHFLLSQ TEKPAVCYQA ITKKLKICEE ETGSTSIQAA DSTAVNGSIT PTDKKIGFLG LGLMGSGIVS NLLKMGHTVT VWNRTAEKCD LFIQEGARLG RTPAEVVSTC DITFACVSDP KAAKDLVLGP SGVLQGIRPG KCYVDMSTVD ADTVTELAQV ...配列: TASEPVKDAD PHFHHFLLSQ TEKPAVCYQA ITKKLKICEE ETGSTSIQAA DSTAVNGSIT PTDKKIGFLG LGLMGSGIVS NLLKMGHTVT VWNRTAEKCD LFIQEGARLG RTPAEVVSTC DITFACVSDP KAAKDLVLGP SGVLQGIRPG KCYVDMSTVD ADTVTELAQV IVSRGGRFLE APVSGNQQLS NDGMLVILAA GDRGLYEDCS SCFQAMGKTS FFLGEVGNAA KMMLIVNMVQ GSFMATIAEG LTLAQVTGQS QQTLLDILNQ GQLASIFLDQ KCQNILQGNF KPDFYLKYIQ KDLRLAIALG DAVNHPTPMA AAANEVYKRA KALDQSDNDM SAVYRAYIH |
要素 #1520 | 名称: H3 / タイプ: protein / 記述: Histone H3 / 分子量: 15.271 / 分子数: 2 / 由来: Xenopus laevis 配列: ARTKQTARKS TGGKAPRKQL ATKAARKSAP ATGGVKKPHR YRPGTVALRE IRRYQKSTEL LIRKLPFQRL VREIAQDFKT DLRFQSSAVM ALQEASEAYL VALFEDTNLC AIHAKRVTIM PKDIQLARRI RGERA |
要素 #1521 | 名称: H4 / タイプ: protein / 記述: Histone H4 / 分子量: 11.236 / 分子数: 2 / 由来: Xenopus laevis 配列: SGRGKGGKGL GKGGAKRHRK VLRDNIQGIT KPAIRRLARR GGVKRISGLI YEETRGVLKV FLENVIRDAV TYTEHAKRKT VTAMDVVYAL KRQGRTLYGF GG |
要素 #1522 | 名称: H2a / タイプ: protein / 記述: Histone H2a / 分子量: 13.95 / 分子数: 2 / 由来: Xenopus laevis 配列: SGRGKQGGKT RAKAKTRSSR AGLQFPVGRV HRLLRKGNYA ERVGAGAPVY LAAVLEYLTA EILELAGNAA RDNKKTRIIP RHLQLAVRND EELNKLLGRV TIAQGGVLPN IQSVLLPKKT ESSKSAKSK |
要素 #1523 | 名称: H2b / タイプ: protein / 記述: Histone H2b / 分子量: 13.494 / 分子数: 2 / 由来: Xenopus laevis 配列: AKSAPAPKKG SKKAVTKTQK KDGKKRRKTR KESYAIYVYK VLKQVHPDTG ISSKAMSIMN SFVNDVFERI AGEASRLAHY NKRSTITSRE IQTAVRLLLP GELAKHAVSE GTKAVTKYTS AK |
要素 #1524 | 名称: 601-147bp / タイプ: DNA / 記述: 147bp 601 Widom sequence / 分子量: 45.202 / 分子数: 1 / 由来: synthetic construct 配列: ATCGAGAATC CCGGTGCCGA GGCCGCTCAA TTGGTCGTAG ACAGCTCTAG CACCGCTTAA ACGCACGTAC GCGCTGTCCC CCGCGTTTTA ACCGCCAAGG GGATTACTCC CTAGTCTCCA GGCACGTGTC AGATATATAC ATCCGAT |
-実験情報
ビーム | 設備名称: ESRF BM29 / 地域: Grenoble / 国: France / 線源: X-ray synchrotron / 波長: 0.1 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 2.87 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: Pilatus 1M / タイプ: Dectris / Pixsize x: 172 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||
スキャン | タイトル: Semi-synthetic nucleosome core particle (NCP) in complex with lysine-specific demethylase (LSD2) and the dehydrogenase domain plus linker of cytokine-like nuclear factor (NPAC delta-205) 測定日: 2017年12月11日 / 保管温度: 4 °C / セル温度: 20 °C / 照射時間: 1 sec. / フレーム数: 70 / 単位: 1/nm /
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結果 | カーブのタイプ: sec /
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