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基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDFL7 |
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![]() | Complex with 1H histone chaperone Asf1, histones H3 and H4, 2H acetyltransferase Rtt109 and histone chaperone Vps75 (1-225aa) in 42% v/v D2O
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機能・相同性 | ![]() : / Formation of Senescence-Associated Heterochromatin Foci (SAHF) / histone H3K23 acetyltransferase activity / histone H3K56 acetyltransferase activity / H3 histone acetyltransferase complex / DNA replication-dependent chromatin disassembly / histone H3K14 acetyltransferase activity / regulation of double-strand break repair via nonhomologous end joining / histone H3K9 acetyltransferase activity / maintenance of rDNA ...: / Formation of Senescence-Associated Heterochromatin Foci (SAHF) / histone H3K23 acetyltransferase activity / histone H3K56 acetyltransferase activity / H3 histone acetyltransferase complex / DNA replication-dependent chromatin disassembly / histone H3K14 acetyltransferase activity / regulation of double-strand break repair via nonhomologous end joining / histone H3K9 acetyltransferase activity / maintenance of rDNA / acetyltransferase activator activity / replication-born double-strand break repair via sister chromatid exchange / retrotransposon silencing / DNA replication-dependent chromatin assembly / nucleosome disassembly / histone H3 acetyltransferase activity / : / histone H3K27 acetyltransferase activity / silent mating-type cassette heterochromatin formation / peptide-lysine-N-acetyltransferase activity / negative regulation of DNA damage checkpoint / subtelomeric heterochromatin formation / ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #3176 | ![]() タイプ: atomic / カイ2乗値: 0.941 / P-value: 0.000001 ![]() |
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モデル #3177 | ![]() タイプ: atomic / カイ2乗値: 2.848 / P-value: 0.000001 ![]() |
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試料
![]() | 名称: Complex with 1H histone chaperone Asf1, histones H3 and H4, 2H acetyltransferase Rtt109 and histone chaperone Vps75 (1-225aa) in 42% v/v D2O 試料濃度: 4 mg/ml / Entity id: 1488 / 1489 / 1490 / 1492 / 1728 |
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バッファ | 名称: 50 mM citrate, 150 mM NaCl, 5 mM BME, 42% D2O / pH: 6.5 |
要素 #1488 | 名称: Vps75 1-225 / タイプ: protein 記述: Vacuolar protein sorting-associated protein 75 (1-225 aa) ![]() 分子量: 26.554 / 分子数: 2 由来: Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) 参照: UniProt: P53853 配列: MMSDQENENE HAKAFLGLAK CEEEVDAIER EVELYRLNKM KPVYEKRDAY IDEIAEFWKI VLSQHVSFAN YIRASDFKYI DTIDKIKVEW LALESEMYDT RDFSITFHFH GIEGDFKEQQ VTKVFQIKKG KDDQEDGILT SEPVPIEWPQ SYDSINPDLI KDKRSPEGKK ...配列: MMSDQENENE HAKAFLGLAK CEEEVDAIER EVELYRLNKM KPVYEKRDAY IDEIAEFWKI VLSQHVSFAN YIRASDFKYI DTIDKIKVEW LALESEMYDT RDFSITFHFH GIEGDFKEQQ VTKVFQIKKG KDDQEDGILT SEPVPIEWPQ SYDSINPDLI KDKRSPEGKK KYRQGMKTIF GWFRWTGLKP GKEFPHGDSL ASLFSEEIYP FCVKYYAEAQ RDLED |
要素 #1489 | 名称: Rtt109 / タイプ: protein / 記述: Histone acetyltransferase RTT109 / 分子量: 50.095 / 分子数: 1 由来: Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) 参照: UniProt: Q07794 配列: MSLNDFLSSV LPVSEQFEYL SLQSIPLETH AVVTPNKDDK RVPKSTIKTQ HFFSLFHQGK VFFSLEVYVY VTLWDEADAE RLIFVSKADT NGYCNTRVSV RDITKIILEF ILSIDPNYYL QKVKPAIRSY KKISPELISA ASTPARTLRI LARRLKQSGS TVLKEIESPR ...配列: MSLNDFLSSV LPVSEQFEYL SLQSIPLETH AVVTPNKDDK RVPKSTIKTQ HFFSLFHQGK VFFSLEVYVY VTLWDEADAE RLIFVSKADT NGYCNTRVSV RDITKIILEF ILSIDPNYYL QKVKPAIRSY KKISPELISA ASTPARTLRI LARRLKQSGS TVLKEIESPR FQQDLYLSFT CPREILTKIC LFTRPASQYL FPDSSKNSKK HILNGEELMK WWGFILDRLL IECFQNDTQA KLRIPGEDPA RVRSYLRGMK YPLWQVGDIF TSKENSLAVY NIPLFPDDPK ARFIHQLAEE DRLLKVSLSS FWIELQERQE FKLSVTSSVM GISGYSLATP SLFPSSADVI VPKSRKQFRA IKKYITGEEY DTEEGAIEAF TNIRDFLLLR MATNLQSLTG KREHRERNQP VPASNINTLA ITMLKPRKKA KALPKT |
要素 #1490 | 名称: Asf1 / タイプ: protein / 記述: Histone chaperone ASF1 / 分子量: 19.125 / 分子数: 1 / 参照: UniProt: P32447 配列: MSIVSLLGIK VLNNPAKFTD PYEFEITFEC LESLKHDLEW KLTYVGSSRS LDHDQELDSI LVGPVPVGVN KFVFSADPPS AELIPASELV SVTVILLSCS YDGREFVRVG YYVNNEYDEE ELRENPPAKV QVDHIVRNIL AEKPRVTRFN IVWDNENEGD LYPPEQPGV |
要素 #1492 | 名称: H4 / タイプ: protein / 記述: Histone H4![]() 配列: MSGRGKGGKG LGKGGAKRHR KVLRDNIQGI TKPAIRRLAR RGGVKRISGL IYEETRGVLK VFLENVIRDA VTYTEHAKRK TVTAMDVVYA LKRQGRTLYG FGG |
要素 #1728 | 名称: H3 FL / タイプ: protein / 記述: Histone H3 full-length / 分子量: 15.328 / 分子数: 1 / 由来: Xenopus laevis / 参照: UniProt: Q6PI79 配列: MARTKQTARK STGGKAPRKQ LATKAARKSA PSTGGVKKPH RYRPGTVALR EIRRYQKSTE LLIRKLPFQR LVREIAQDFK TDLRFQSAAI GALQEASEAY LVGLFEDTNL CAIHAKRVTI MPKDIQLARR IRGERA |
-実験情報
ビーム | 設備名称: ILL D22 / 地域: Grenoble / 国: France ![]() | |||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: 128 linear sensitive Reuter-Stokes detector / タイプ: 3He multidetector / Pixsize x: 0.8 mm | |||||||||||||||||||||
スキャン | 測定日: 2016年11月14日 / セル温度: 25.2 °C / 照射時間: 3600 sec. / フレーム数: 1 / 単位: 1/A /
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距離分布関数 P(R) |
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結果 |
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