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-基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDFH6 |
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試料 | Probable exodeoxyribonuclease III protein XthA, sliding beta clamp, DNA ligase-A tricomplex in the presence of DNA substrate
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生物種 | Mycobacterium tuberculosis (結核菌) Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (結核菌) |
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-Data source
SASBDBのページ | SASDFH6 |
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-モデル
-試料
試料 | 名称: Probable exodeoxyribonuclease III protein XthA, sliding beta clamp, DNA ligase-A tricomplex in the presence of DNA substrate 試料濃度: 2.5 mg/ml / Entity id: 1670 / 1671 / 1672 / 1673 |
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バッファ | 名称: 50 mM Tris pH 8.0, 200 mM NaCl , 2 mM β-mercaptoethanol pH: 8 |
要素 #1670 | 名称: MtbXthA / タイプ: protein / 記述: Probable exodeoxyribonuclease III protein XthA / 分子量: 30.699 / 分子数: 1 / 由来: Mycobacterium tuberculosis 配列: MRLATWNVNS VKARLPRLLA WLDETKPDVV CLQETKSAAD GFPSGDVAEL GYTTAAYGEG RWNGVAILSR VGIEDVSKSF PGEPVYQGEA PAGPGVQTQL TEPVLLAPQA RAIGATCGGI RVWSLYAPNG RTPESAHYLY KLEWFAALRD ALAAELSAGT PLVATGDYNV ...配列: MRLATWNVNS VKARLPRLLA WLDETKPDVV CLQETKSAAD GFPSGDVAEL GYTTAAYGEG RWNGVAILSR VGIEDVSKSF PGEPVYQGEA PAGPGVQTQL TEPVLLAPQA RAIGATCGGI RVWSLYAPNG RTPESAHYLY KLEWFAALRD ALAAELSAGT PLVATGDYNV APTDDDVWDP SVFVGSTHVT PAERQALAEL RDLGLHDIVP TPMKGPHPYT YWDYRAGSFH KDLGMRIDLV YGNGAFAERV RSAYVDREAR KGRGPSDHAP VVVDLDHHHH HH |
要素 #1671 | タイプ: protein / 記述: DNA ligase A / 分子量: 76.111 / 分子数: 1 由来: Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) 配列: MSSPDADQTA PEVLRQWQAL AEEVREHQFR YYVRDAPIIS DAEFDELLRR LEALEEQHPE LRTPDSPTQL VGGAGFATDF EPVDHLERML SLDNAFTADE LAAWAGRIHA EVGDAAHYLC ELKIDGVALS LVYREGRLTR ASTRGDGRTG EDVTLNARTI ADVPERLTPG ...配列: MSSPDADQTA PEVLRQWQAL AEEVREHQFR YYVRDAPIIS DAEFDELLRR LEALEEQHPE LRTPDSPTQL VGGAGFATDF EPVDHLERML SLDNAFTADE LAAWAGRIHA EVGDAAHYLC ELKIDGVALS LVYREGRLTR ASTRGDGRTG EDVTLNARTI ADVPERLTPG DDYPVPEVLE VRGEVFFRLD DFQALNASLV EEGKAPFANP RNSAAGSLRQ KDPAVTARRR LRMICHGLGH VEGFRPATLH QAYLALRAWG LPVSEHTTLA TDLAGVRERI DYWGEHRHEV DHEIDGVVVK VDEVALQRRL GSTSRAPRWA IAYKYPPEEA QTKLLDIRVN VGRTGRITPF AFMTPVKVAG STVGQATLHN ASEIKRKGVL IGDTVVIRKA GDVIPEVLGP VVELRDGSER EFIMPTTCPE CGSPLAPEKE GDADIRCPNA RGCPGQLRER VFHVASRNGL DIEVLGYEAG VALLQAKVIA DEGELFALTE RDLLRTDLFR TKAGELSANG KRLLVNLDKA KAAPLWRVLV ALSIRHVGPT AARALATEFG SLDAIAAAST DQLAAVEGVG PTIAAAVTEW FAVDWHREIV DKWRAAGVRM VDERDESVPR TLAGLTIVVT GSLTGFSRDD AKEAIVARGG KAAGSVSKKT NYVVAGDSPG SKYDKAVELG VPILDEDGFR RLLADGPASR THHHHHH |
要素 #1672 | タイプ: protein / 記述: Beta sliding clamp / 分子量: 42.935 / 分子数: 2 由来: Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) 配列: MDAATTRVGL TDLTFRLLRE SFADAVSWVA KNLPARPAVP VLSGVLLTGS DNGLTISGFD YEVSAEAQVG AEIVSPGSVL VSGRLLSDIT RALPNKPVDV HVEGNRVALT CGNARFSLPT MPVEDYPTLP TLPEETGLLP AELFAEAISQ VAIAAGRDDT LPMLTGIRVE ...配列: MDAATTRVGL TDLTFRLLRE SFADAVSWVA KNLPARPAVP VLSGVLLTGS DNGLTISGFD YEVSAEAQVG AEIVSPGSVL VSGRLLSDIT RALPNKPVDV HVEGNRVALT CGNARFSLPT MPVEDYPTLP TLPEETGLLP AELFAEAISQ VAIAAGRDDT LPMLTGIRVE ILGETVVLAA TDRFRLAVRE LKWSASSPDI EAAVLVPAKT LAEAAKAGIG GSDVRLSLGT GPGVGKDGLL GISGNGKRST TRLLDAEFPK FRQLLPTEHT AVATMDVAEL IEAIKLVALV ADRGAQVRME FADGSVRLSA GADDVGRAEE DLVVDYAGEP LTIAFNPTYL TDGLSSLRSE RVSFGFTTAG KPALLRPVSG DDRPVAGLNG NGPFPAVSTD YVYLLMPVRL PGHHHHHH |
要素 #1673 | タイプ: DNA / 記述: DNA ligase A nicked DNA substrate / 分子量: 8.1 / 分子数: 2 配列: GGTAGATCAG TGTCTATGTA TGTCAG |
-実験情報
ビーム | 設備名称: ESRF BM29 / 地域: Grenoble / 国: France / 線源: X-ray synchrotron / 波長: 0.0992 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 2.9 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: Pilatus 1M / タイプ: Dectris / Pixsize x: 172 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||
スキャン | タイトル: Probable exodeoxyribonuclease III protein XthA, sliding beta clamp, DNA ligase-A tricomplex in the presence of DNA substrate 測定日: 2017年5月17日 / 保管温度: 4 °C / セル温度: 10 °C / 照射時間: 1 sec. / フレーム数: 10 / 単位: 1/nm /
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結果 | カーブのタイプ: single_conc コメント: The presented model shows the spatial alignment of several individually calculated models and does not fit the SAXS data. A corresponding individual model fit (individual model not ...コメント: The presented model shows the spatial alignment of several individually calculated models and does not fit the SAXS data. A corresponding individual model fit (individual model not provided for this entry) is shown. The sample is severely aggregated.
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