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-基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDFF6 |
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試料 | Probable exodeoxyribonuclease III protein XthA, sliding beta clamp complex
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機能・相同性 | 機能・相同性情報 : / エキソデオキシリボヌクレアーゼIII / DNA polymerase III complex / DNA strand elongation involved in DNA replication / 3'-5' exonuclease activity / peptidoglycan-based cell wall / endonuclease activity / DNA-directed DNA polymerase activity / response to antibiotic / DNA修復 ...: / エキソデオキシリボヌクレアーゼIII / DNA polymerase III complex / DNA strand elongation involved in DNA replication / 3'-5' exonuclease activity / peptidoglycan-based cell wall / endonuclease activity / DNA-directed DNA polymerase activity / response to antibiotic / DNA修復 / DNA binding / extracellular region / identical protein binding / 細胞質 類似検索 - 分子機能 |
生物種 | Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (結核菌) |
登録者 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #3016 | タイプ: dummy / ソフトウェア: (DAMAVER) / ダミー原子の半径: 3.00 A / カイ2乗値: 0.774 / P-value: 0.340933 |
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-試料
試料 | 名称: Probable exodeoxyribonuclease III protein XthA, sliding beta clamp complex 試料濃度: 2.5 mg/ml / Entity id: 1652 / 1654 |
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バッファ | 名称: 50 mM Tris-HCl, 200 mM NaCl, 2 mM β-mercaptoethanol pH: 8 |
要素 #1652 | タイプ: protein / 記述: Beta sliding clamp / 分子量: 42.935 / 分子数: 2 由来: Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) 参照: UniProt: P9WNU1 配列: MDAATTRVGL TDLTFRLLRE SFADAVSWVA KNLPARPAVP VLSGVLLTGS DNGLTISGFD YEVSAEAQVG AEIVSPGSVL VSGRLLSDIT RALPNKPVDV HVEGNRVALT CGNARFSLPT MPVEDYPTLP TLPEETGLLP AELFAEAISQ VAIAAGRDDT LPMLTGIRVE ...配列: MDAATTRVGL TDLTFRLLRE SFADAVSWVA KNLPARPAVP VLSGVLLTGS DNGLTISGFD YEVSAEAQVG AEIVSPGSVL VSGRLLSDIT RALPNKPVDV HVEGNRVALT CGNARFSLPT MPVEDYPTLP TLPEETGLLP AELFAEAISQ VAIAAGRDDT LPMLTGIRVE ILGETVVLAA TDRFRLAVRE LKWSASSPDI EAAVLVPAKT LAEAAKAGIG GSDVRLSLGT GPGVGKDGLL GISGNGKRST TRLLDAEFPK FRQLLPTEHT AVATMDVAEL IEAIKLVALV ADRGAQVRME FADGSVRLSA GADDVGRAEE DLVVDYAGEP LTIAFNPTYL TDGLSSLRSE RVSFGFTTAG KPALLRPVSG DDRPVAGLNG NGPFPAVSTD YVYLLMPVRL PGHHHHHH |
要素 #1654 | タイプ: protein 記述: Probable exodeoxyribonuclease III protein XthA (Exonuclease III) (EXO III) (AP endonuclease VI) 分子量: 32.931 / 分子数: 1 由来: Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) 参照: UniProt: P96273 配列: MPDGTIDGGH PQRPASPRLR SPLLRLATWN VNSIRTRLDR VLDWLGRADV DVLAMQETKC PDGQFPALPL FELGYDVAHV GFDQWNGVAI ASRVGLDDVR VGFDGQPSWS GKPEVAATTE ARALGATCGG IRVWSLYVPN GRALDDPHYT YKLDWLAALR DTAEGWLRDD ...配列: MPDGTIDGGH PQRPASPRLR SPLLRLATWN VNSIRTRLDR VLDWLGRADV DVLAMQETKC PDGQFPALPL FELGYDVAHV GFDQWNGVAI ASRVGLDDVR VGFDGQPSWS GKPEVAATTE ARALGATCGG IRVWSLYVPN GRALDDPHYT YKLDWLAALR DTAEGWLRDD PAAPIALMGD WNIAPTDDDV WSTEFFAGCT HVSEPERKAF NAIVDAQFTD VVRPFTPGPG VYTYWDYTQL RFPKKQGMRI DFILGSPALA ARVMDAQIVR EERKGKAPSD HAPVLVDLHA GHHHHHH |
-実験情報
ビーム | 設備名称: ESRF BM29 / 地域: Grenoble / 国: France / 線源: X-ray synchrotronシンクロトロン / 波長: 0.0992 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 2.867 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: Pilatus 1M / タイプ: Dectris / Pixsize x: 172 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||
スキャン | タイトル: Probable exodeoxyribonuclease III protein XthA, sliding beta clamp complex 測定日: 2017年5月15日 / 保管温度: 4 °C / セル温度: 10 °C / 照射時間: 1 sec. / フレーム数: 10 / 単位: 1/nm /
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距離分布関数 P(R) | ソフトウェア P(R): GNOM 5.0 / ポイント数: 431 /
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結果 | カーブのタイプ: single_conc コメント: The presented model shows the spatial alignment of several individually calculated models and does not fit the SAXS data. A corresponding individual model fit (individual model not ...コメント: The presented model shows the spatial alignment of several individually calculated models and does not fit the SAXS data. A corresponding individual model fit (individual model not provided for this entry) is shown.
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