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-基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDF66 |
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試料 | DNA-binding protein HU-alpha bound to 80 base-pair DNA at pH 4.5 with 300 mM NaCl
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機能・相同性 | 機能・相同性情報 HU-DNA complex / DnaA-HU complex / bacterial nucleoid packaging / chromosome condensation / DNA replication initiation / structural constituent of chromatin / DNA repair / DNA-templated transcription / DNA damage response / DNA binding ...HU-DNA complex / DnaA-HU complex / bacterial nucleoid packaging / chromosome condensation / DNA replication initiation / structural constituent of chromatin / DNA repair / DNA-templated transcription / DNA damage response / DNA binding / identical protein binding / membrane / cytosol 類似検索 - 分子機能 |
生物種 | Escherichia coli (大腸菌) Escherichia coli K-12 (大腸菌) Escherichia coli (strain K12) (大腸菌) |
登録者 |
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-試料
試料 | 名称: DNA-binding protein HU-alpha bound to 80 base-pair DNA at pH 4.5 with 300 mM NaCl Entity id: 1622 / 1623 / 1624 |
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バッファ | 名称: 10 mM sodium acetate, 300 mM NaCl / pH: 4.5 |
要素 #1622 | タイプ: DNA / 記述: 80bp_DNA Forward / 分子量: 24.849 / 分子数: 1 / 由来: Escherichia coli 配列: AATGAGGTAA CAACGAAAGC AGATGATAGC TGCTTATCAA TTTGTTGCAA ACAAGTAGCC GCGCCCAATG AGGTAACAAT |
要素 #1623 | タイプ: DNA / 記述: 80bp_DNA Reverse / 分子量: 24.612 / 分子数: 1 / 由来: Escherichia coli K-12 配列: TTACTCCATT GTTGCTTTCG TCTACTATCG ACGAATAGTT AAACAACGTT TGTTCATCGG CGCGGGTTAC TCCATTGTTA |
要素 #1624 | タイプ: protein / 記述: DNA-binding protein HU-alpha / 分子量: 9.535 / 由来: Escherichia coli (strain K12) / 参照: UniProt: P0ACF0 配列: MNKTQLIDVI AEKAELSKTQ AKAALESTLA AITESLKEGD AVQLVGFGTF KVNHRAERTG RNPQTGKEIK IAAANVPAFV SGKALKDAVK |
-実験情報
ビーム | 設備名称: Advanced Light Source (ALS) 12.3.1 (SIBYLS) / 地域: Berkeley, CA / 国: USA / 線源: X-ray synchrotron / 波長: 0.103 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 1.5 mm | ||||||
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検出器 | 名称: Pilatus3 X 2M / Pixsize x: 172 mm | ||||||
スキャン | タイトル: DNA-binding protein HU-alpha bound to 80 base-pair DNA at pH 4.5 with 300 mM NaCl 測定日: 2018年6月1日 / セル温度: 10 °C / 照射時間: 3 sec. / フレーム数: 300 / 単位: 1/A /
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結果 | Experimental MW: 300 kDa / Rg from PR: 2 nm / カーブのタイプ: single_conc コメント: SAXS profile corresponds to a protein-DNA complex between bacterial nucleoid associated protein HUalpha and 80bp DNA. Under these conditions, the complex forms lamellar structures ...コメント: SAXS profile corresponds to a protein-DNA complex between bacterial nucleoid associated protein HUalpha and 80bp DNA. Under these conditions, the complex forms lamellar structures visible as Bragg Diffraction peaks. |