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-基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDEF2 |
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試料 | Mitochondrial import inner membrane translocase complex TIM9·10
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機能・相同性 | 機能・相同性情報 mitochondrial intermembrane space protein transporter complex / TIM22 mitochondrial import inner membrane insertion complex / Mitochondrial protein import / protein insertion into mitochondrial inner membrane / protein transporter activity / mitochondrial intermembrane space / unfolded protein binding / mitochondrial inner membrane / mitochondrion / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 |
生物種 | Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (パン酵母) |
引用 | ジャーナル: Cell / 年: 2018 タイトル: Structural Basis of Membrane Protein Chaperoning through the Mitochondrial Intermembrane Space. 著者: Katharina Weinhäupl / Caroline Lindau / Audrey Hessel / Yong Wang / Conny Schütze / Tobias Jores / Laura Melchionda / Birgit Schönfisch / Hubert Kalbacher / Beate Bersch / Doron Rapaport / ...著者: Katharina Weinhäupl / Caroline Lindau / Audrey Hessel / Yong Wang / Conny Schütze / Tobias Jores / Laura Melchionda / Birgit Schönfisch / Hubert Kalbacher / Beate Bersch / Doron Rapaport / Martha Brennich / Kresten Lindorff-Larsen / Nils Wiedemann / Paul Schanda / 要旨: The exchange of metabolites between the mitochondrial matrix and the cytosol depends on β-barrel channels in the outer membrane and α-helical carrier proteins in the inner membrane. The essential ...The exchange of metabolites between the mitochondrial matrix and the cytosol depends on β-barrel channels in the outer membrane and α-helical carrier proteins in the inner membrane. The essential translocase of the inner membrane (TIM) chaperones escort these proteins through the intermembrane space, but the structural and mechanistic details remain elusive. We have used an integrated structural biology approach to reveal the functional principle of TIM chaperones. Multiple clamp-like binding sites hold the mitochondrial membrane proteins in a translocation-competent elongated form, thus mimicking characteristics of co-translational membrane insertion. The bound preprotein undergoes conformational dynamics within the chaperone binding clefts, pointing to a multitude of dynamic local binding events. Mutations in these binding sites cause cell death or growth defects associated with impairment of carrier and β-barrel protein biogenesis. Our work reveals how a single mitochondrial "transfer-chaperone" system is able to guide α-helical and β-barrel membrane proteins in a "nascent chain-like" conformation through a ribosome-free compartment. |
登録者 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #2188 | タイプ: mix / ダミー原子の半径: 1.90 A / カイ2乗値: 0.57 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
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モデル #2189 | タイプ: dummy / ソフトウェア: (r6669) / ダミー原子の半径: 2.10 A / 対称性: C3 / カイ2乗値: 1.378 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
モデル #2236 | タイプ: atomic コメント: The model is a snapshot from the ensemble creating the fit. Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
-試料
試料 | 名称: Mitochondrial import inner membrane translocase complex TIM9·10 試料濃度: 1.00-5.00 / Entity id: 1218 / 1219 |
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バッファ | 名称: 50mM Tris, 150mM NaCl / pH: 7.4 |
要素 #1218 | 名称: TIM9 / タイプ: protein 記述: Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM9 分子量: 10.202 / 分子数: 3 由来: Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) 参照: UniProt: O74700 配列: MDALNSKEQQ EFQKVVEQKQ MKDFMRLYSN LVERCFTDCV NDFTTSKLTN KEQTCIMKCS EKFLKHSERV GQRFQEQNAA LGQGLGR |
要素 #1219 | タイプ: protein 記述: Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM10 分子量: 10.23 / 分子数: 3 由来: Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) 参照: UniProt: P87108 配列: GSFLGFGGGQ PQLSSQQKIQ AAEAELDLVT DMFNKLVNNC YKKCINTSYS EGELNKNESS CLDRCVAKYF ETNVQVGENM QKMGQSFNAA GKF |
-実験情報
ビーム | 設備名称: ESRF BM29 / 地域: Grenoble / 国: France / 線源: X-ray synchrotron / 波長: 0.099 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 2.864 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: Pilatus 1M / タイプ: Dectris / Pixsize x: 172 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
スキャン | タイトル: Mitochondrial import inner membrane translocase complex TIM9·10 測定日: 2015年8月27日 / 保管温度: 35 °C / セル温度: 20 °C / 照射時間: 20 sec. / フレーム数: 1 / 単位: 1/nm /
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距離分布関数 P(R) | ソフトウェア P(R): GNOM 5.0 / ポイント数: 687 /
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結果 | カーブのタイプ: merged
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