SASDBN9: Putative DNA binding protein YeeF-CT in complex with the cognate ...

基本情報

• 登録情報: データベース: SASBDB / ID: SASDBN9

試料

Putative DNA binding protein YeeF-CT in complex with the cognate immunity protein YezG from Bacillus subtilis

• Putative DNA binding protein (protein), YeeF, Bacillus subtilis subsp. spizizenii (strain ATCC 23059 / NRRL B-14472 / W23)
• YezG, cognate immunity protein of YeeF (protein), YezG, Bacillus subtilis subsp. spizizenii str. W23

機能・相同性

分子機能:

cytoplasm

ドメイン・相同性:

LXG domain / LXG domain of WXG superfamily / LXG domain profile. / Immunity protein YezG-like / Immunity protein YezG-like superfamily / Type VII secretion system protein EssD-like / Immunity protein YezG-like / DNA/RNA non-specific endonuclease / DNA/RNA non-specific endonuclease superfamily

構成要素:

Immunity protein YezG / Putative DNA binding protein

• 生物種: Bacillus subtilis subsp. spizizenii (strain ATCC 23059 / NRRL B-14472 / W23) (バクテリア); Bacillus subtilis subsp. spizizenii str. W23

登録者

• Krishan Gopal (CSIR-INSTITUTE OF MICROBIAL TECHNOLOGY, Chandigarh, India)

モデル

• モデル #1104: ; タイプ: dummy / ソフトウェア: DAMMIN and DAMAVER (2.7.2) / ダミー原子の半径: 4.00 A / カイ2乗値: 0.812

試料

• 試料: 名称: Putative DNA binding protein YeeF-CT in complex with the cognate immunity protein YezG from Bacillus subtilis; 試料濃度: 7.5 mg/ml / Entity id: 573 / 574
• バッファ: 名称: 20 mM HEPES 150 mM NaCl / pH: 7.5

要素 #573

名称: YeeF / タイプ: protein / 記述: Putative DNA binding protein / 分子量: 18.402 / 分子数: 2
由来: Bacillus subtilis subsp. spizizenii (strain ATCC 23059 / NRRL B-14472 / W23)
参照: UniProt: E0TU96_BAC
配列:

MGSSHHHHHH SSGLVPRSHM ASIYKTKEGY TYTTDNYGRI TSVKADLQLG EAKRNQYAQS HAGKPQDRKP DDDGGALIAT QFKGSGQFDN IVPMNSQINR SGGRWYEMEQ EWAKALKEEP PQKVNVNIKA IYKGDSLRPD KFIVKFRIGD ADFEKVTIKN QSGG

要素 #574

名称: YezG / タイプ: protein / 記述: YezG, cognate immunity protein of YeeF / 分子量: 19.234 / 分子数: 1 / 由来: Bacillus subtilis subsp. spizizenii str. W23 / 参照: UniProt: E0TU95
配列:

MDTPKMGDLY QRIANQINEM IPSEWENVYL YAEILDDSSE VYFYFNIPGK NEFLYSHNIP EHFNVSEDIY DDLLIELQES FEELREEYEK NNPETWTNLT LKLDRTGQFS IDYNYEDVIA SELNGSQRKA VWVYKNLGLM PKRKTVRDFL EDYIKTNEGK I

実験情報

• ビーム: 設備名称: IMTECH / 地域: Chandigarh / 国: India / 線源: X-ray in house / 波長: 0.15418 Å
• 検出器: 名称: 1D CMOS Mythen detector / タイプ: Diode

スキャン

タイトル: Putative DNA binding protein YeeF-CT (528-669) in complex with the cognate immunity protein YezG from Bacillus subtilis
測定日: 2016年8月18日 / 保管温度: 4 °C / セル温度: 25 °C / 照射時間: 1800 sec. / フレーム数: 1 / 単位: 1/nm /

	Min	Max
Q	0.1206	7.0014

距離分布関数 P(R)

ソフトウェア P(R): GNOM 5.0 / ポイント数: 290 /

	Min	Max
Q	0.133373	1.98015
P(R) point	1	290
R	0	14.1

結果

カーブのタイプ: single_conc /

	実験値	Porod
分子量	72.03 kDa	72.03 kDa
体積	-	115.26 nm3

	P(R)	P(R) error	Guinier	Guinier error
前方散乱 I0	72150	1510	72749	2036
慣性半径, Rg	4.15 nm	0.09	4.04 nm	0.18

	Min	Max
D	-	14.1
Guinier point	2	32