ChemComp-RPD: (C8-R)-HYDANTOCIDIN 5'-PHOSPHATE

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: RPD
• 名称: 名称: (C8-R)-hydantocidin 5'-phosphate; 別称: [8,9-DIHYDROXY-3-(4-CARBOXY-HYDROXY-HYDROXYMETHYL-AMINO-BUTYL)-2,4-DIOXO-6-OXA-1,3-DIAZA-SPIRO[4.4]NON-7-YLMETHYL]

Chemical information

組成

組成式: C₁₃H₂₂N₃O₁₃P / 原子数: 52 / 化学式量: 459.3 / 形式電荷: 0

その他

1qf4

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: RPD / モデル座標のPDB-ID: 1QF4

履歴

作成	1999年7月8日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2020年6月5日

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詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=C(O)C(N(O)CO)CCCN2C(=O)C1(OC(C(O)C1O)COP(=O)(O)O)NC2=O
• CACTVS 3.341: OCN(O)[CH](CCCN1C(=O)N[C]2(O[CH](CO[P](O)(O)=O)[CH](O)[CH]2O)C1=O)C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C(CC(C(=O)O)N(CO)O)CN1C(=O)C2(C(C(C(O2)COP(=O)(O)O)O)O)NC1=O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: OCN(O)[C@H](CCCN1C(=O)N[C@@]2(O[C@H](CO[P](O)(O)=O)[C@@H](O)[C@H]2O)C1=O)C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C(C[C@H](C(=O)O)[N@](CO)O)CN1C(=O)[C@@]2([C@@H]([C@@H]([C@H](O2)COP(=O)(O)O)O)O)NC1=O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C13H22N3O13P/c17-5-16(24)6(10(20)21)2-1-3-15-11(22)13(14-12(15)23)9(19)8(18)7(29-13)4-28-30(25,26)27/h6-9,17-19,24H,1-5H2,(H,14,23)(H,20,21)(H2,25,26,27)/t6-,7-,8-,9-,13+/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: MAXSFYCTFIBEAR-OJMIUMIFSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: 5-{(5S,7R,8S,9R)-8,9-dihydroxy-2,4-dioxo-7-[(phosphonooxy)methyl]-6-oxa-1,3-diazaspiro[4.4]non-3-yl}-N-hydroxy-N-(hydroxymethyl)-D-norvaline
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: (2R)-5-[(2R,3S,4R,5S)-3,4-dihydroxy-7,9-dioxo-2-(phosphonooxymethyl)-1-oxa-6,8-diazaspiro[4.4]nonan-8-yl]-2-(hydroxy-(hydroxymethyl)amino)pentanoic acid

PDBエントリ

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PDB-1qf4:
DESIGN, SYNTHESIS, AND X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF AN ENZYME BOUND BISUBSTRATE HYBRID INHIBITOR OF ADENYLOSUCCINATE SYNTHETASE