ChemComp-RN6: 2-[(6S)-4-(4-chlorophenyl)-2,3,9-trimethyl-6H-thieno[3,2-f][1,2,4...

IDまたはキーワード:

登録情報	データベース: PDB化学物質要素 / ID: RN6
名称	名称: 2-[(6S)-4-(4-chlorophenyl)-2,3,9-trimethyl-6H-thieno[3,2-f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-6-yl]-N-(8-{[({2-[(3S)-2,6-dioxopiperidin-3-yl]-1,3-dioxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}oxy) ...名称: 2-[(6S)-4-(4-chlorophenyl)-2,3,9-trimethyl-6H-thieno[3,2-f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-6-yl]-N-(8-{[({2-[(3S)-2,6-dioxopiperidin-3-yl]-1,3-dioxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}oxy)acetyl]amino}octyl)acetamide

登録情報

データベース: PDB化学物質要素 / ID: RN6

名称

名称: 2-[(6S)-4-(4-chlorophenyl)-2,3,9-trimethyl-6H-thieno[3,2-f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-6-yl]-N-(8-{[({2-[(3S)-2,6-dioxopiperidin-3-yl]-1,3-dioxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}oxy) ...

組成

組成式: C₄₂H₄₅ClN₈O₇S / 原子数: 104 / 化学式量: 841.374 / 形式電荷: 0

その他

6boy

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: RN6 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 6BOY

履歴

作成	2017年11月22日
公開	2018年5月30日

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構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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SMILES

ACDLabs 12.01	n1c(C)n5c(n1)C(CC(NCCCCCCCCNC(=O)COc3cccc4C(=O)N(C2C(=O)NC(CC2)=O)C(c34)=O)=O)N=C(c6c5sc(C)c6C)c7ccc(cc7)Cl
CACTVS 3.385	Cc1sc2n3c(C)nnc3[CH](CC(=O)NCCCCCCCCNC(=O)COc4cccc5C(=O)N([CH]6CCC(=O)NC6=O)C(=O)c45)N=C(c7ccc(Cl)cc7)c2c1C
OpenEye OEToolkits 2.0.6	Cc1c(sc-2c1C(=NC(c3n2c(nn3)C)CC(=O)NCCCCCCCCNC(=O)COc4cccc5c4C(=O)N(C5=O)C6CCC(=O)NC6=O)c7ccc(cc7)Cl)C

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SMILES CANONICAL

CACTVS 3.385	Cc1sc2n3c(C)nnc3[C@H](CC(=O)NCCCCCCCCNC(=O)COc4cccc5C(=O)N([C@H]6CCC(=O)NC6=O)C(=O)c45)N=C(c7ccc(Cl)cc7)c2c1C
OpenEye OEToolkits 2.0.6	Cc1c(sc-2c1C(=N[C@H](c3n2c(nn3)C)CC(=O)NCCCCCCCCNC(=O)COc4cccc5c4C(=O)N(C5=O)[C@H]6CCC(=O)NC6=O)c7ccc(cc7)Cl)C

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InChI

InChI 1.03	InChI=1S/C42H45ClN8O7S/c1-23-24(2)59-42-35(23)37(26-13-15-27(43)16-14-26)46-29(38-49-48-25(3)50(38)42)21-33(53)44-19-8-6-4-5-7-9-20-45-34(54)22-58-31-12-10-11-28-36(31)41(57)51(40(28)56)30-17-18-32(52)47-39(30)55/h10-16,29-30H,4-9,17-22H2,1-3H3,(H,44,53)(H,45,54)(H,47,52,55)/t29-,30-/m0/s1

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InChIKey

InChI 1.03	JGQPZPLJOBHHBK-KYJUHHDHSA-N

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SYSTEMATIC NAME

ACDLabs 12.01	2-[(6S)-4-(4-chlorophenyl)-2,3,9-trimethyl-6H-thieno[3,2-f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-6-yl]-N-(8-{[({2-[(3S)-2,6-dioxopiperidin-3-yl]-1,3-dioxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}oxy)acetyl]amino}octyl)acetamide
OpenEye OEToolkits 2.0.6	~{N}-[8-[2-[2-[(3~{S})-2,6-bis(oxidanylidene)piperidin-3-yl]-1,3-bis(oxidanylidene)isoindol-4-yl]oxyethanoylamino]octyl]-2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanamide

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PDB-6boy:
Crystal structure of DDB1-CRBN-BRD4(BD1) complex bound to dBET6 PROTAC.

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関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

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