ChemComp-RER: vancosamine

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: RER
• 名称: 名称: vancosamine; 別称: (1R,3S,4S,5S)-3-amino-2,3,6-trideoxy-3-methyl-alpha-L-arabino-hexopyranose
• コメント: 抗生剤*YM

Chemical information

組成

組成式: C₇H₁₅NO₃ / 原子数: 26 / 化学式量: 161.199 / 形式電荷: 0

その他

1c0q

タイプ: L-saccharide, alpha linking / PDB分類: ATOMS / 3文字コード: RER / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 1C0Q

履歴

作成	2010年9月6日
記述子を修正	2011年6月4日
Other modification	2020年7月3日
Modify name	2020年7月17日
Modify synonyms	2020年7月17日
Modify linking type	2020年7月17日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / PubChem / SureChEMBL / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: OC1OC(C(O)C(N)(C)C1)C
• CACTVS 3.352: C[CH]1O[CH](O)C[C](C)(N)[CH]1O
• OpenEye OEToolkits 1.6.1: CC1C(C(CC(O1)O)(C)N)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.352: C[C@@H]1O[C@@H](O)C[C@](C)(N)[C@@H]1O
• OpenEye OEToolkits 1.6.1: C[C@H]1[C@H]([C@@](C[C@@H](O1)O)(C)N)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C7H15NO3/c1-4-6(10)7(2,8)3-5(9)11-4/h4-6,9-10H,3,8H2,1-2H3/t4-,5+,6+,7-/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: OIJZDPGKNVKVBL-WNJXEPBRSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: 3-amino-2,3,6-trideoxy-3-methyl-alpha-L-lyxo-hexopyranose
• OpenEye OEToolkits 1.6.1: (2R,4S,5S,6S)-4-amino-4,6-dimethyl-oxane-2,5-diol

PDBエントリ

全2件を表示しています

PDB-1gac:
NMR structure of asymmetric homodimer of a82846b, a glycopeptide antibiotic, complexed with its cell wall pentapeptide fragment

PDB-8g82:
Vancomycin bound to D-Ala-D-Ser