ChemComp-Q3X: ~{N}-[5-[4-[2-[2-[2-[2-[3-[[3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(...

IDまたはキーワード:

登録情報	データベース: PDB化学物質要素 / ID: Q3X
名称	名称: ~{N}-[5-[4-[2-[2-[2-[2-[3-[[3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-3- ...名称: ~{N}-[5-[4-[2-[2-[2-[2-[3-[[3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-3-oxidanylidene-propoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylcarbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanylidene-4-(trifluoromethyl)-3~{H}-pyridine-3-carboxamide

登録情報

データベース: PDB化学物質要素 / ID: Q3X

名称

名称: ~{N}-[5-[4-[2-[2-[2-[2-[3-[[3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-3- ...

組成

組成式: C₅₈H₇₂F₃N₉O₁₁S / 原子数: 154 / 化学式量: 1160.306 / 形式電荷: 0

その他

8bb3

タイプ: non-polymer / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: Q3X / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 8BB3

履歴

作成	2022年10月12日
aromatic_flag"を修正	2022年10月14日
公開	2022年11月9日

外部リンク

UniChem /

ChemSpider /

PubChem /

Wikipedia search /

Google search

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
SMILES

CACTVS 3.385	CN1CCN(CC1)c2ccc(cc2NC(=O)c3cnc(O)cc3C(F)(F)F)c4ccc(cc4)C(=O)NCCOCCOCCOCCOCCC(=O)N[CH](C(=O)N5C[CH](O)C[CH]5C(=O)NCc6ccc(cc6)c7scnc7C)C(C)(C)C
OpenEye OEToolkits 3.1.0.0	Cc1c(scn1)c2ccc(cc2)CNC(=O)C3CC(CN3C(=O)C(C(C)(C)C)NC(=O)CCOCCOCCOCCOCCNC(=O)c4ccc(cc4)c5ccc(c(c5)NC(=O)c6cnc(cc6C(F)(F)F)O)N7CCN(CC7)C)O

-
SMILES CANONICAL

CACTVS 3.385	CN1CCN(CC1)c2ccc(cc2NC(=O)c3cnc(O)cc3C(F)(F)F)c4ccc(cc4)C(=O)NCCOCCOCCOCCOCCC(=O)N[C@H](C(=O)N5C[C@H](O)C[C@H]5C(=O)NCc6ccc(cc6)c7scnc7C)C(C)(C)C
OpenEye OEToolkits 3.1.0.0	Cc1c(scn1)c2ccc(cc2)CNC(=O)[C@@H]3C[C@H](CN3C(=O)[C@H](C(C)(C)C)NC(=O)CCOCCOCCOCCOCCNC(=O)c4ccc(cc4)c5ccc(c(c5)NC(=O)c6cnc(cc6C(F)(F)F)O)N7CCN(CC7)C)O

-
InChI

InChI 1.06	InChI=1S/C58H72F3N9O11S/c1-37-51(82-36-65-37)40-8-6-38(7-9-40)33-64-55(76)48-31-43(71)35-70(48)56(77)52(57(2,3)4)67-49(72)16-22-78-24-26-80-28-29-81-27-25-79-23-17-62-53(74)41-12-10-39(11-13-41)42-14-15-47(69-20-18-68(5)19-21-69)46(30-42)66-54(75)44-34-63-50(73)32-45(44)58(59,60)61/h6-15,30,32,34,36,43,48,52,71H,16-29,31,33,35H2,1-5H3,(H,62,74)(H,63,73)(H,64,76)(H,66,75)(H,67,72)/t43-,48+,52-/m1/s1

InChI 1.06

InChI=1S/C58H72F3N9O11S/c1-37-51(82-36-65-37)40-8-6-38(7-9-40)33-64-55(76)48-31-43(71)35-70(48)56(77)52(57(2,3)4)67-49(72)16-22-78-24-26-80-28-29-81-27-25-79-23-17-62-53(74)41-12-10-39(11-13-41)42-14-15-47(69-20-18-68(5)19-21-69)46(30-42)66-54(75)44-34-63-50(73)32-45(44)58(59,60)61/h6-15,30,32,34,36,43,48,52,71H,16-29,31,33,35H2,1-5H3,(H,62,74)(H,63,73)(H,64,76)(H,66,75)(H,67,72)/t43-,48+,52-/m1/s1

-
InChIKey

InChI 1.06	MZOFELXFRDGDBN-GYPJNVOQSA-N

全2件を表示しています

PDB-8bb2:
Structure of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC with PEG linker (conformation #2)

PDB-8bb3:
Structure of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC with PEG linker (conformation #1)

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
Chemical information

-
構造の表示

-
詳細

-
SMILES

-
SMILES CANONICAL

-
InChI

-
InChIKey

-
PDBエントリ

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-Chemical information

-構造の表示

-詳細

-SMILES

-SMILES CANONICAL

-InChI

-InChIKey

-PDBエントリ

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
Chemical information

-
構造の表示

-
詳細

-
SMILES

-
SMILES CANONICAL

-
InChI

-
InChIKey

-
PDBエントリ

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)