ChemComp-PR8: 5'-O-[(R)-hydroxy{[(2S)-pyrrolidin-2-ylcarbonyl]oxy}phosphoryl]ad...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: PR8
• 名称: 名称: 5'-O-[(R)-hydroxy{[(2S)-pyrrolidin-2-ylcarbonyl]oxy}phosphoryl]adenosine; 別称: prolyl-adenylate / 日化辞名称: プロリルアデニル酸

Chemical information

組成

組成式: C₁₅H₂₁N₆O₈P / 原子数: 51 / 化学式量: 444.336 / 形式電荷: 0

その他

3ial

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: PR8 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3IAL

履歴

作成	2009年7月16日
aromatic_flag"を修正	2011年6月4日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2021年3月1日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / 日化辞 / PubChem / SureChEMBL / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 11.02: O=P(OC(=O)C1NCCC1)(O)OCC4OC(n3cnc2c(ncnc23)N)C(O)C4O
• CACTVS 3.352: Nc1ncnc2n(cnc12)[CH]3O[CH](CO[P](O)(=O)OC(=O)[CH]4CCCN4)[CH](O)[CH]3O
• OpenEye OEToolkits 1.7.0: c1nc(c2c(n1)n(cn2)C3C(C(C(O3)COP(=O)(O)OC(=O)C4CCCN4)O)O)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.352: Nc1ncnc2n(cnc12)[C@@H]3O[C@H](CO[P](O)(=O)OC(=O)[C@@H]4CCCN4)[C@@H](O)[C@H]3O
• OpenEye OEToolkits 1.7.0: c1nc(c2c(n1)n(cn2)[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)CO[P@@](=O)(O)OC(=O)[C@@H]4CCCN4)O)O)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C15H21N6O8P/c16-12-9-13(19-5-18-12)21(6-20-9)14-11(23)10(22)8(28-14)4-27-30(25,26)29-15(24)7-2-1-3-17-7/h5-8,10-11,14,17,22-23H,1-4H2,(H,25,26)(H2,16,18,19)/t7-,8+,10+,11+,14+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: KQFKHTAASHMYDJ-TWBCTODHSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 11.02: 5'-O-[(R)-hydroxy{[(2S)-pyrrolidin-2-ylcarbonyl]oxy}phosphoryl]adenosine
• OpenEye OEToolkits 1.6.1: [[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl] (2S)-pyrrolidine-2-carboxylate

PDBエントリ

全3件を表示しています

PDB-3ial:
Giardia lamblia Prolyl-tRNA synthetase in complex with prolyl-adenylate

PDB-7v8j:
Toxoplasma gondii Prolyl-tRNA Synthetase (TgPRS) in complex with the reaction intermediates proline-adenylate (Pro-AMP) and pyrophosphate

PDB-9bfd:
Tyrocidine synthetase modules 1 and 2 crosslinked in the condensation state, complex A