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- PDB-9k3n: The structure of Salmonella phage PJNS002 -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 9k3n
タイトルThe structure of Salmonella phage PJNS002
要素
  • DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
  • DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
  • DNA-binding protein J
  • capsid protein F
  • spike protein G
キーワードVIRUS / structual proteins
機能・相同性DNA
機能・相同性情報
生物種Salmonella phage PJNS002 (ファージ)
手法電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.59 Å
データ登録者Hu, W.L. / Chen, Y.B. / Wei, Y.M. / Gao, Y.
資金援助 中国, 1件
組織認可番号国
Other government23QA1406400 中国
引用ジャーナル: Commun Biol / 年: 2025
タイトル: Structural basis for Salmonella infection by two Microviridae phages.
著者: Wanlong Hu / Zhengjie Liu / Yuming Wei / Qucheng Bian / Weiqi Lan / Chongzheng Fan / Jiaoyang Song / Qianqian Sun / Xiaojie Zhang / Yuqing Liu / Yan Gao / Yibao Chen /
要旨: The global resurgence of multidrug-resistant Salmonella species, responsible for millions of annual infections, underscores the urgent need for alternative antimicrobial strategies, such as phage ...The global resurgence of multidrug-resistant Salmonella species, responsible for millions of annual infections, underscores the urgent need for alternative antimicrobial strategies, such as phage therapy. Microviridae phages offer a promising model for studying phage-host interactions with their unique structural and infection mechanisms. Here, we identify two Microviridae phages, PJNS001 and PJNS002, with different host receptor dependencies, and determine their cryo-EM structures at 2.68 Å and 2.59 Å resolution, respectively. These icosahedral capsids with T = 1 symmetry exhibit a unique vertex reinforcement mechanism, stabilizing the viral assembly. The specific pentameric adaptations, coupled with DNA binding protein engagements and thermodynamic constraints, collectively preclude the formation of hybrid virions. Structural analysis and in situ visualization reveal spike protein features and host-attachment intermediates, informing host specificity. Together, these findings advance our understanding of Microviridae infection mechanisms and provide a structural framework for rational phage design against antibiotic-resistant pathogens.
履歴
登録2024年10月19日登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBC
改定 1.02025年8月13日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.02025年8月13日Data content type: EM metadata / Data content type: EM metadata / Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.02025年8月13日Data content type: FSC / Data content type: FSC / Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.02025年8月13日Data content type: Half map / Part number: 1 / Data content type: Half map / Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.02025年8月13日Data content type: Half map / Part number: 2 / Data content type: Half map / Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.02025年8月13日Data content type: Image / Data content type: Image / Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.02025年8月13日Data content type: Primary map / Data content type: Primary map / Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12025年8月20日Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / citation_author / em_admin
Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year / _em_admin.last_update

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

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集合体

登録構造単位
F: capsid protein F
G: spike protein G
J: DNA-binding protein J
A: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
U: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
B: capsid protein F
C: spike protein G
D: DNA-binding protein J
E: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
a: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
H: capsid protein F
I: spike protein G
K: DNA-binding protein J
L: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
b: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
M: capsid protein F
N: spike protein G
O: DNA-binding protein J
P: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
c: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
Q: capsid protein F
R: spike protein G
S: DNA-binding protein J
T: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
d: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
V: capsid protein F
W: spike protein G
X: DNA-binding protein J
Y: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
e: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
Z: capsid protein F
AA: spike protein G
BA: DNA-binding protein J
CA: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
f: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
DA: capsid protein F
EA: spike protein G
FA: DNA-binding protein J
GA: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
g: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
HA: capsid protein F
IA: spike protein G
JA: DNA-binding protein J
KA: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
h: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
LA: capsid protein F
MA: spike protein G
NA: DNA-binding protein J
OA: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
i: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
PA: capsid protein F
QA: spike protein G
RA: DNA-binding protein J
SA: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
j: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
TA: capsid protein F
UA: spike protein G
VA: DNA-binding protein J
WA: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
k: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
XA: capsid protein F
YA: spike protein G
ZA: DNA-binding protein J
AB: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
l: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
BB: capsid protein F
CB: spike protein G
DB: DNA-binding protein J
EB: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
m: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
FB: capsid protein F
GB: spike protein G
HB: DNA-binding protein J
IB: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
n: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
JB: capsid protein F
KB: spike protein G
LB: DNA-binding protein J
MB: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
o: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
NB: capsid protein F
OB: spike protein G
PB: DNA-binding protein J
QB: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
p: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
RB: capsid protein F
SB: spike protein G
TB: DNA-binding protein J
UB: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
q: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
VB: capsid protein F
WB: spike protein G
XB: DNA-binding protein J
YB: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
r: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
ZB: capsid protein F
AC: spike protein G
BC: DNA-binding protein J
CC: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
s: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
DC: capsid protein F
EC: spike protein G
FC: DNA-binding protein J
GC: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
t: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
HC: capsid protein F
IC: spike protein G
JC: DNA-binding protein J
KC: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
u: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
LC: capsid protein F
MC: spike protein G
NC: DNA-binding protein J
OC: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
v: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
PC: capsid protein F
QC: spike protein G
RC: DNA-binding protein J
SC: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
w: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
TC: capsid protein F
UC: spike protein G
VC: DNA-binding protein J
WC: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
x: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
XC: capsid protein F
YC: spike protein G
ZC: DNA-binding protein J
AD: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
y: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
BD: capsid protein F
CD: spike protein G
DD: DNA-binding protein J
ED: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
z: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
FD: capsid protein F
GD: spike protein G
HD: DNA-binding protein J
ID: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
0: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
JD: capsid protein F
KD: spike protein G
LD: DNA-binding protein J
MD: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
1: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
ND: capsid protein F
OD: spike protein G
PD: DNA-binding protein J
QD: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
2: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
RD: capsid protein F
SD: spike protein G
TD: DNA-binding protein J
UD: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
3: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
VD: capsid protein F
WD: spike protein G
XD: DNA-binding protein J
YD: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
4: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
ZD: capsid protein F
AE: spike protein G
BE: DNA-binding protein J
CE: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
5: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
DE: capsid protein F
EE: spike protein G
FE: DNA-binding protein J
GE: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
6: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
HE: capsid protein F
IE: spike protein G
JE: DNA-binding protein J
KE: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
7: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
LE: capsid protein F
ME: spike protein G
NE: DNA-binding protein J
OE: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
8: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
PE: capsid protein F
QE: spike protein G
RE: DNA-binding protein J
SE: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
9: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
TE: capsid protein F
UE: spike protein G
VE: DNA-binding protein J
WE: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
aA: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
XE: capsid protein F
YE: spike protein G
ZE: DNA-binding protein J
AF: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
bA: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
BF: capsid protein F
CF: spike protein G
DF: DNA-binding protein J
EF: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
cA: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
FF: capsid protein F
GF: spike protein G
HF: DNA-binding protein J
IF: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
dA: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
JF: capsid protein F
KF: spike protein G
LF: DNA-binding protein J
MF: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
eA: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
NF: capsid protein F
OF: spike protein G
PF: DNA-binding protein J
QF: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
fA: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
RF: capsid protein F
SF: spike protein G
TF: DNA-binding protein J
UF: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
gA: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
VF: capsid protein F
WF: spike protein G
XF: DNA-binding protein J
YF: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
hA: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
ZF: capsid protein F
AG: spike protein G
BG: DNA-binding protein J
CG: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
iA: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
DG: capsid protein F
EG: spike protein G
FG: DNA-binding protein J
GG: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
jA: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
HG: capsid protein F
IG: spike protein G
JG: DNA-binding protein J
KG: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
kA: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
LG: capsid protein F
MG: spike protein G
NG: DNA-binding protein J
OG: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
lA: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
PG: capsid protein F
QG: spike protein G
RG: DNA-binding protein J
SG: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
mA: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
TG: capsid protein F
UG: spike protein G
VG: DNA-binding protein J
WG: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
nA: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
XG: capsid protein F
YG: spike protein G
ZG: DNA-binding protein J
AH: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
oA: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
BH: capsid protein F
CH: spike protein G
DH: DNA-binding protein J
EH: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
pA: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
FH: capsid protein F
GH: spike protein G
HH: DNA-binding protein J
IH: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
qA: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
JH: capsid protein F
KH: spike protein G
LH: DNA-binding protein J
MH: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
rA: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
NH: capsid protein F
OH: spike protein G
PH: DNA-binding protein J
QH: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
sA: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
RH: capsid protein F
SH: spike protein G
TH: DNA-binding protein J
UH: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
tA: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
VH: capsid protein F
WH: spike protein G
XH: DNA-binding protein J
YH: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
uA: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
ZH: capsid protein F
AI: spike protein G
BI: DNA-binding protein J
CI: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
vA: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')
DI: capsid protein F
EI: spike protein G
FI: DNA-binding protein J
GI: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')
wA: DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)4,376,473300
ポリマ－4,376,473300
非ポリマー00
水00
1


  • 登録構造と同一
  • 登録者が定義した集合体
  • 根拠: 電子顕微鏡法, not applicable
タイプ名称対称操作数
identity operation1_5551

-
要素

#1: タンパク質 ...
capsid protein F


分子量: 48418.332 Da / 分子数: 60 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Salmonella phage PJNS002 (ファージ)
#2: タンパク質 ...
spike protein G


分子量: 18864.549 Da / 分子数: 60 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Salmonella phage PJNS002 (ファージ)
#3: タンパク質・ペプチド ...
DNA-binding protein J


分子量: 2929.386 Da / 分子数: 60 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Salmonella phage PJNS002 (ファージ)
#4: DNA鎖 ...
DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*AP*A)-3')


分子量: 1521.077 Da / 分子数: 60 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Salmonella phage PJNS002 (ファージ)
#5: DNA鎖 ...
DNA (5'-D(P*AP*AP*AP*A)-3')


分子量: 1207.870 Da / 分子数: 60 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Salmonella phage PJNS002 (ファージ)
Has protein modificationN

-
実験情報

-
実験

実験手法: 電子顕微鏡法
EM実験試料の集合状態: PARTICLE / ３次元再構成法: 単粒子再構成法

-
試料調製

構成要素名称: Microviridae / タイプ: VIRUS / 詳細: T=1 icosahedral virus / Entity ID: #1-#3 / 由来: NATURAL
分子量値: 4.31 MDa / 実験値: NO
由来(天然)生物種: Salmonella phage PJNS002 (ファージ)
ウイルスについての詳細中空か: YES / エンベロープを持つか: NO / 単離: SPECIES / タイプ: VIRION
天然宿主生物種: Salmonella
ウイルス殻直径: 290 nm / 三角数 (T数): 1
緩衝液pH: 7.5 / 詳細: pH 7.2~7.6
緩衝液成分
ID濃度名称式Buffer-ID
1137 mmol/Lsodium chlorideNaCl1
22.65 mmol/Lpotassium chlorideKCl1
310 mmol/Ldibasic sodium phosphateNa2HPO41
41.75 mmol/Lpotassium dihydrogen phosphateKH2PO41
試料包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES
試料支持グリッドの材料: COPPER / グリッドのサイズ: 300 divisions/in. / グリッドのタイプ: Quantifoil R1.2/1.3
急速凍結装置: FEI VITROBOT MARK IV / 凍結剤: ETHANE / 湿度: 100 % / 凍結前の試料温度: 277 K

-
電子顕微鏡撮影

実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company
顕微鏡モデル: FEI TITAN KRIOS
電子銃電子線源: FIELD EMISSION GUN / 加速電圧: 300 kV / 照射モード: FLOOD BEAM
電子レンズモード: BRIGHT FIELD / 倍率（公称値）: 22500 X / 最大 デフォーカス（公称値）: 2000 nm / 最小 デフォーカス（公称値）: 800 nm / Calibrated defocus min: 400 nm / 最大 デフォーカス（補正後）: 3000 nm / Cs: 2.7 mm / C2レンズ絞り径: 70 µm / アライメント法: COMA FREE
試料ホルダ凍結剤: NITROGEN
試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
撮影平均露光時間: 1.25 sec. / 電子線照射量: 50 e/Å2 / フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 実像数: 3827
画像スキャン横: 5760 / 縦: 4092

-
解析

EMソフトウェア
ID名称バージョンカテゴリ
1cryoSPARC4.0.1粒子像選択
2SerialEM4.1.9画像取得
4cryoSPARC4.0.1CTF補正
7PHENIX1.20.1モデルフィッティング
9cryoSPARC4.0.1初期オイラー角割当
10cryoSPARC4.0.1最終オイラー角割当
11cryoSPARC4.0.1分類
12cryoSPARC4.0.1３次元再構成
13PHENIX1.20.1モデル精密化
CTF補正タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION
粒子像の選択選択した粒子像数: 528658
対称性点対称性: I (正20面体型対称)
3次元再構成解像度: 2.59 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 86486 / アルゴリズム: FOURIER SPACE / クラス平均像の数: 1 / 対称性のタイプ: POINT
原子モデル構築B value: 18.15 / プロトコル: RIGID BODY FIT / 空間: REAL
原子モデル構築Source name: AlphaFold / タイプ: in silico model

+
万見について

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お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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