登録情報 データベース : PDB / ID : 8w7l 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Cryo-EM structure of ClassIII Lanthipeptide modification enzyme PneKC mutant H522A. 要素(PneA) x 2 (Protein kinase domain-containing protein) x 2 詳細キーワード ANTIMICROBIAL PROTEIN / Lanthibiotic / RiPPs / LanKC / CryoEM / Antimicrobial peptides / Antiviral peptides.機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
peptide modification / protein kinase activity / ATP binding 類似検索 - 分子機能 Lanthionine synthetase C-like protein / Lanthionine synthetase C-like / : / Protein kinase domain profile. / Protein kinase domain / Protein kinase-like domain superfamily 類似検索 - ドメイン・相同性 PHOSPHATE ION / Protein kinase domain-containing protein 類似検索 - 構成要素生物種 Streptococcus pneumoniae (肺炎レンサ球菌)手法 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度 : 3.75 Å 詳細データ登録者 Li, Y. / Luo, M. / Shao, K. / Li, J. / Li, Z. 資金援助 シンガポール, 1件 詳細 詳細を隠す組織 認可番号 国 Ministry of Education (MoE, Singapore) シンガポール
引用ジャーナル : To Be Published タイトル : Structure of PneA bound PneKC at 3.75 Angstroms resolution.著者 : Li, Y. / Luo, M. / Shao, K. / Li, J. / Li, Z. 履歴 登録 2023年8月30日 登録サイト : PDBJ / 処理サイト : PDBJ改定 1.0 2024年9月4日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.0 2024年9月4日 Data content type : EM metadata / Data content type : EM metadata / Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.0 2024年9月4日 Data content type : FSC / Data content type : FSC / Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.0 2024年9月4日 Data content type : Half map / Part number : 1 / Data content type : Half map / Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.0 2024年9月4日 Data content type : Half map / Part number : 2 / Data content type : Half map / Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.0 2024年9月4日 Data content type : Image / Data content type : Image / Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.0 2024年9月4日 Data content type : Primary map / Data content type : Primary map / Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.0 2024年9月4日 Data content type : FSC / Data content type : FSC / Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.0 2024年9月4日 Data content type : Half map / Part number : 1 / Data content type : Half map / Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.0 2024年9月4日 Data content type : Half map / Part number : 2 / Data content type : Half map / Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.0 2024年9月4日 Data content type : Image / Data content type : Image / Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.0 2024年9月4日 Data content type : Primary map / Data content type : Primary map / Provider : repository / タイプ : Initial release改定 2.0 2024年11月6日 Group : Advisory / Atomic model ... Advisory / Atomic model / Data collection / Database references / Derived calculations / Polymer sequence / Refinement description / Source and taxonomy / Structure summary カテゴリ : atom_site / em_admin ... atom_site / em_admin / em_entity_assembly / em_imaging / entity / entity_name_com / entity_poly / entity_poly_seq / entity_src_gen / pdbx_contact_author / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_entry_details / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_poly_seq_scheme / pdbx_struct_assembly / pdbx_struct_oper_list / pdbx_struct_sheet_hbond / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / pdbx_unobs_or_zero_occ_residues / pdbx_validate_main_chain_plane / pdbx_validate_peptide_omega / pdbx_validate_rmsd_angle / pdbx_validate_torsion / refine_ls_restr / struct_asym / struct_conf / struct_ref / struct_ref_seq / struct_ref_seq_dif / struct_sheet / struct_sheet_order / struct_sheet_range Item : _em_admin.last_update / _em_entity_assembly.entity_id_list ... _em_admin.last_update / _em_entity_assembly.entity_id_list / _em_imaging.microscope_model / _pdbx_entity_nonpoly.entity_id / _pdbx_entry_details.has_protein_modification / _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num / _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id / _pdbx_struct_assembly.details / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation / _refine_ls_restr.dev_ideal / _refine_ls_restr.number / _struct_asym.entity_id / _struct_ref_seq.db_align_beg / _struct_ref_seq.db_align_end / _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg / _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end / _struct_ref_seq.pdbx_db_accession / _struct_ref_seq.pdbx_strand_id / _struct_ref_seq.ref_id / _struct_ref_seq.seq_align_end 解説 : Model completeness詳細 : To correct residue placement and remove models exhibiting ambiguous electron density, ensuring higher accuracy and structural clarity.Provider : author / タイプ : Coordinate replacement改定 2.1 2025年7月2日 Group : Data collection / カテゴリ : em_admin / em_software / Item : _em_admin.last_update / _em_software.name改定 1.1 2025年7月2日 Data content type : EM metadata / Data content type : EM metadata / EM metadata / Group : Data processing / Experimental summary / Data content type : EM metadata / EM metadata / カテゴリ : em_admin / em_software / Data content type : EM metadata / EM metadata / Item : _em_admin.last_update / _em_software.name
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