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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8poh | ||||||
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タイトル | Influenza A/H7N9 polymerase symmetric dimer bound to the promoter (PA K289A/C489R) | ||||||
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![]() | VIRAL PROTEIN / Viral polymerase | ||||||
機能・相同性 | ![]() cap snatching / viral transcription / symbiont-mediated suppression of host mRNA transcription via inhibition of RNA polymerase II activity / host cell mitochondrion / 7-methylguanosine mRNA capping / virion component / endonuclease activity / host cell cytoplasm / 加水分解酵素; エステル加水分解酵素 / RNA-directed RNA polymerase ...cap snatching / viral transcription / symbiont-mediated suppression of host mRNA transcription via inhibition of RNA polymerase II activity / host cell mitochondrion / 7-methylguanosine mRNA capping / virion component / endonuclease activity / host cell cytoplasm / 加水分解酵素; エステル加水分解酵素 / RNA-directed RNA polymerase / viral RNA genome replication / RNA-dependent RNA polymerase activity / nucleotide binding / DNA-templated transcription / host cell nucleus / RNA binding / metal ion binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.3 Å | ||||||
![]() | Arragain, B. / Cusack, S. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: The host RNA polymerase II C-terminal domain is the anchor for replication of the influenza virus genome. 著者: Tim Krischuns / Benoît Arragain / Catherine Isel / Sylvain Paisant / Matthias Budt / Thorsten Wolff / Stephen Cusack / Nadia Naffakh / ![]() ![]() 要旨: The current model is that the influenza virus polymerase (FluPol) binds either to host RNA polymerase II (RNAP II) or to the acidic nuclear phosphoprotein 32 (ANP32), which drives its conformation ...The current model is that the influenza virus polymerase (FluPol) binds either to host RNA polymerase II (RNAP II) or to the acidic nuclear phosphoprotein 32 (ANP32), which drives its conformation and activity towards transcription or replication of the viral genome, respectively. Here, we provide evidence that the FluPol-RNAP II binding interface, beyond its well-acknowledged function in cap-snatching during transcription initiation, has also a pivotal role in replication of the viral genome. Using a combination of cell-based and in vitro approaches, we show that the RNAP II C-terminal-domain, jointly with ANP32, enhances FluPol replication activity. We observe successive conformational changes to switch from a transcriptase to a replicase conformation in the presence of the bound RNPAII C-terminal domain and propose a model in which the host RNAP II is the anchor for transcription and replication of the viral genome. Our data open new perspectives on the spatial coupling of viral transcription and replication and the coordinated balance between these two activities. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 561.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 427.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1.3 MB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1.4 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 79.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 120 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 17792MC ![]() 8pm0C ![]() 8pnpC ![]() 8pnqC ![]() 8r3kC ![]() 8r3lC M: このデータのモデリングに利用したマップデータ C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 84394.117 Da / 分子数: 2 / 変異: K289A; C489R / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 遺伝子: PA / 発現宿主: ![]() #2: タンパク質 | 分子量: 86496.156 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 遺伝子: PB1 / 発現宿主: ![]() #3: タンパク質 | 分子量: 88937.438 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 遺伝子: PB2 / 発現宿主: ![]() #4: RNA鎖 | 分子量: 16093.369 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 由来: (合成) ![]() #5: 化合物 | ChemComp-MG / | 研究の焦点であるリガンドがあるか | Y | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
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試料調製
構成要素 |
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分子量 | 実験値: NO | ||||||||||||||||||||||||
由来(天然) |
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由来(組換発現) |
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緩衝液 | pH: 8 | ||||||||||||||||||||||||
試料 | 濃度: 0.2 mg/ml / 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES | ||||||||||||||||||||||||
急速凍結 | 装置: FEI VITROBOT MARK IV / 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡撮影
顕微鏡 | モデル: TFS GLACIOS |
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電子銃 | 電子線源: ![]() |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2000 nm / 最小 デフォーカス(公称値): 800 nm / Cs: 2.7 mm |
試料ホルダ | 試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER |
撮影 | 電子線照射量: 40 e/Å2 フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON IV (4k x 4k) |
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解析
EMソフトウェア |
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CTF補正 | タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3次元再構成 | 解像度: 3.3 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 278761 / 対称性のタイプ: POINT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子モデル構築 | 空間: REAL | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子モデル構築 | PDB-ID: 7Z4O Accession code: 7Z4O / Source name: PDB / タイプ: experimental model | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
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