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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8pn1 | |||||||||
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タイトル | CryoEM structure of Nal1 protein, allele SPIKE, from Oryza sativa japonica group | |||||||||
要素 | Protein NARROW LEAF 1 | |||||||||
キーワード | PLANT PROTEIN / Serine protease | |||||||||
機能・相同性 | stem vascular tissue pattern formation / internode patterning / regulation of leaf development / leaf vascular tissue pattern formation / Peptidase S1, PA clan / nucleoplasm / cytoplasm / ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / Protein NARROW LEAF 1 機能・相同性情報 | |||||||||
生物種 | Oryza sativa Japonica Group (イネ) | |||||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.4 Å | |||||||||
データ登録者 | Huang, L.Y. / Rety, S. / Xi, X.G. | |||||||||
資金援助 | 中国, フランス, 2件
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引用 | ジャーナル: Nat Plants / 年: 2024 タイトル: The catalytic triad of rice NARROW LEAF1 involves H234. 著者: Ling-Yun Huang / Na-Nv Liu / Wei-Fei Chen / Xia Ai / Hai-Hong Li / Ze-Lin Zhang / Xi-Miao Hou / Philippe Fossé / Olivier Mauffret / Dong-Sheng Lei / Stephane Rety / Xu-Guang Xi / 要旨: NARROW LEAF1 (NAL1) exerts a multifaceted influence on leaf morphology and crop yield. Recent crystal study proposed that histidine 233 (H233) is part of the catalytic triad. Here we report that ...NARROW LEAF1 (NAL1) exerts a multifaceted influence on leaf morphology and crop yield. Recent crystal study proposed that histidine 233 (H233) is part of the catalytic triad. Here we report that unlike suggested previously, H234 instead of H233 is a component of the catalytic triad alongside residues D291 and S385 in NAL1. Remarkably, residue 233 unexpectedly plays a pivotal role in regulating NAL1's proteolytic activity. These findings establish a strong foundation for utilizing NAL1 in breeding programs aimed at improving crop yield. | |||||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 8pn1.cif.gz | 579.4 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb8pn1.ent.gz | 表示 | PDB形式 | |
PDBx/mmJSON形式 | 8pn1.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 8pn1_validation.pdf.gz | 1.5 MB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 8pn1_full_validation.pdf.gz | 1.5 MB | 表示 | |
XML形式データ | 8pn1_validation.xml.gz | 70.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 8pn1_validation.cif.gz | 103 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/pn/8pn1 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/pn/8pn1 | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | 17766MC 8pmeC 8pmgC 8pmiC 8pmlC 8pmmC 8pn2C M: このデータのモデリングに利用したマップデータ C: 同じ文献を引用 (文献) |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索 |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCSドメイン:
NCSドメイン領域: Ens-ID: ens_1
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