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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8k0x | ||||||
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タイトル | ABCG25 Wild Type purified with DDM in the ABA-bound state | ||||||
![]() | ABC transporter G family member 25 | ||||||
![]() | TRANSPORT PROTEIN / ABA / ABCG / plant hormone | ||||||
機能・相同性 | ![]() intercellular transport / negative regulation of post-embryonic development / abscisic acid transport / export from cell / response to abscisic acid / abscisic acid-activated signaling pathway / efflux transmembrane transporter activity / ATPase-coupled transmembrane transporter activity / ABC-type transporter activity / response to cold ...intercellular transport / negative regulation of post-embryonic development / abscisic acid transport / export from cell / response to abscisic acid / abscisic acid-activated signaling pathway / efflux transmembrane transporter activity / ATPase-coupled transmembrane transporter activity / ABC-type transporter activity / response to cold / transmembrane transport / response to heat / ATP hydrolysis activity / ATP binding / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.2 Å | ||||||
![]() | Sun, L. / Liu, X. / Ying, W. / Liao, L. / Wei, H. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: ABCG25 Wild Type purified with DDM in the ABA-bound state 著者: Sun, L. / Liu, X. / Ying, W. / Liao, L. / Wei, H. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 193.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 154 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 36780MC M: このデータのモデリングに利用したマップデータ C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 72983.867 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: ABCG25 / 細胞株 (発現宿主): Sf9 発現宿主: ![]() ![]() 参照: UniProt: Q84TH5 #2: 化合物 | ChemComp-A8S / ( | 研究の焦点であるリガンドがあるか | Y | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
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試料調製
構成要素 | 名称: ABCG25 from Arabidopsis thaliana purified with DDM / タイプ: ORGANELLE OR CELLULAR COMPONENT / Entity ID: #1 / 由来: RECOMBINANT |
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分子量 | 実験値: NO |
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
由来(組換発現) | 生物種: ![]() ![]() |
緩衝液 | pH: 7.4 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES |
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: ![]() |
電子レンズ | モード: DIFFRACTION / 最大 デフォーカス(公称値): 2300 nm / 最小 デフォーカス(公称値): 1500 nm |
撮影 | 電子線照射量: 50 e/Å2 フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k) |
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解析
EMソフトウェア | 名称: PHENIX / バージョン: 1.13_2998: / カテゴリ: モデル精密化 |
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CTF補正 | タイプ: NONE |
3次元再構成 | 解像度: 3.2 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 223649 / 対称性のタイプ: POINT |