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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8iet | ||||||
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タイトル | Human SLC26A3 in the apo state | ||||||
要素 | Chloride anion exchanger | ||||||
キーワード | MEMBRANE PROTEIN / Transporter | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 Defective SLC26A3 causes congenital secretory chloride diarrhea 1 (DIAR1) / Multifunctional anion exchangers / sulfate transmembrane transporter activity / secondary active sulfate transmembrane transporter activity / oxalate transmembrane transporter activity / intracellular pH elevation / chloride:bicarbonate antiporter activity / solute:inorganic anion antiporter activity / membrane hyperpolarization / bicarbonate transmembrane transporter activity ...Defective SLC26A3 causes congenital secretory chloride diarrhea 1 (DIAR1) / Multifunctional anion exchangers / sulfate transmembrane transporter activity / secondary active sulfate transmembrane transporter activity / oxalate transmembrane transporter activity / intracellular pH elevation / chloride:bicarbonate antiporter activity / solute:inorganic anion antiporter activity / membrane hyperpolarization / bicarbonate transmembrane transporter activity / monoatomic anion transport / chloride transmembrane transporter activity / sperm capacitation / monoatomic ion transport / cellular response to cAMP / sperm midpiece / brush border membrane / apical plasma membrane / membrane / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | ||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.5 Å | ||||||
データ登録者 | Li, X.R. / Chi, X.M. / Zhang, Y.Y. / Zhou, Q. | ||||||
資金援助 | 中国, 1件
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引用 | ジャーナル: To Be Published タイトル: Human SLC26A3 in the apo state 著者: Li, X.R. / Chi, X.M. / Zhang, Y.Y. / Zhou, Q. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 8iet.cif.gz | 230.8 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb8iet.ent.gz | 184.7 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 8iet.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ie/8iet ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ie/8iet | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | 35393MC M: このデータのモデリングに利用したマップデータ C: 同じ文献を引用 (文献) |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索 |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 84591.523 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: SLC26A3, DRA / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P40879 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
-試料調製
構成要素 | 名称: Human SLC26A3 in the apo state / タイプ: CELL / Entity ID: all / 由来: NATURAL |
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由来(天然) | 生物種: Homo sapiens (ヒト) |
由来(組換発現) | 生物種: Homo sapiens (ヒト) |
緩衝液 | pH: 7.4 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES |
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE |
-電子顕微鏡撮影
実験機器 | モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: FIELD EMISSION GUN / 加速電圧: 300 kV / 照射モード: FLOOD BEAM |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2200 nm / 最小 デフォーカス(公称値): 1200 nm |
撮影 | 電子線照射量: 50 e/Å2 / フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) |
-解析
EMソフトウェア | 名称: RELION / カテゴリ: 3次元再構成 |
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CTF補正 | タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION |
3次元再構成 | 解像度: 3.5 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 142727 / 対称性のタイプ: POINT |