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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8e6j | ||||||
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タイトル | 3H03 Fab in complex with influenza virus neuraminidase from A/Brevig Mission/1/1918 (H1N1) | ||||||
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機能・相同性 | ![]() exo-alpha-(2->3)-sialidase activity / exo-alpha-(2->6)-sialidase activity / exo-alpha-(2->8)-sialidase activity / ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Turner, H.L. / Ozorowski, G. / Ward, A.B. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Human anti-N1 monoclonal antibodies elicited by pandemic H1N1 virus infection broadly inhibit HxN1 viruses in vitro and in vivo. 著者: Lena Hansen / Meagan McMahon / Hannah L Turner / Xueyong Zhu / Jackson S Turner / Gabriel Ozorowski / Daniel Stadlbauer / Juha Vahokoski / Aaron J Schmitz / Amena A Rizk / Wafaa B Alsoussi / ...著者: Lena Hansen / Meagan McMahon / Hannah L Turner / Xueyong Zhu / Jackson S Turner / Gabriel Ozorowski / Daniel Stadlbauer / Juha Vahokoski / Aaron J Schmitz / Amena A Rizk / Wafaa B Alsoussi / Shirin Strohmeier / Wenli Yu / José Alberto Choreño-Parra / Luis Jiménez-Alvarez / Alfredo Cruz-Lagunas / Joaquín Zúñiga / Philip A Mudd / Rebecca J Cox / Ian A Wilson / Andrew B Ward / Ali H Ellebedy / Florian Krammer / ![]() ![]() ![]() 要旨: Neuraminidase (NA) is one of the two influenza virus surface glycoproteins, and antibodies that target it are an independent correlate of protection. However, our current understanding of NA ...Neuraminidase (NA) is one of the two influenza virus surface glycoproteins, and antibodies that target it are an independent correlate of protection. However, our current understanding of NA antigenicity is incomplete. Here, we describe human monoclonal antibodies (mAbs) from a patient with a pandemic H1N1 virus infection in 2009. Two mAbs exhibited broad reactivity and inhibited NA enzyme activity of seasonal H1N1 viruses circulating before and after 2009, as well as viruses with avian or swine N1s. The mAbs provided robust protection from lethal challenge with human H1N1 and avian H5N1 viruses in mice, and both target an epitope on the lateral face of NA. In summary, we identified two broadly protective NA antibodies that share a novel epitope, inhibited NA activity, and provide protection against virus challenge in mice. Our work reaffirms that NA should be included as a target in future broadly protective or universal influenza virus vaccines. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 489 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 384.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
#1: タンパク質 | ![]() 分子量: 49726.387 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 株: A/Brevig Mission/1/1918 H1N1 / 遺伝子: NA / 細胞株 (発現宿主): Sf9 発現宿主: ![]() ![]() ![]() 参照: UniProt: Q9IGQ6, ![]() #2: 抗体 | 分子量: 23361.855 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() #3: 抗体 | 分子量: 24484.332 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: ![]() |
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試料調製
構成要素 | 名称: 3H03 Fab in complex with influenza virus neuraminidase from A/Brevig Mission/1/1918 (H1N1) タイプ: COMPLEX / Entity ID: all / 由来: MULTIPLE SOURCES | ||||||||||||||||||||
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分子量 | 実験値: NO | ||||||||||||||||||||
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() | ||||||||||||||||||||
由来(組換発現) | 生物種: ![]() ![]() ![]() | ||||||||||||||||||||
緩衝液 | pH: 7.4 | ||||||||||||||||||||
緩衝液成分 |
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試料 | 濃度: 1.3 mg/ml / 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色![]() ![]() | ||||||||||||||||||||
試料支持 | グリッドの材料: COPPER / グリッドのサイズ: 300 divisions/in. / グリッドのタイプ: Quantifoil R1.2/1.3 | ||||||||||||||||||||
急速凍結![]() | 装置: FEI VITROBOT MARK IV / 凍結剤: ETHANE / 湿度: 100 % |
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電子顕微鏡撮影
顕微鏡 | モデル: TFS GLACIOS |
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電子銃 | 電子線源![]() ![]() |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD![]() |
試料ホルダ | 凍結剤: NITROGEN 試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER |
撮影 | 平均露光時間: 7.51 sec. / 電子線照射量: 41.1 e/Å2 フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON IV (4k x 4k) 実像数: 3862 |
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解析
ソフトウェア | 名称: PHENIX / バージョン: 1.20.1_4487: / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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EMソフトウェア |
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CTF補正![]() | タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
対称性 | 点対称性![]() ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3次元再構成![]() | 解像度: 2.7 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 37387 / 対称性のタイプ: POINT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子モデル構築 | PDB-ID: 3BEQ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
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