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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7xs7 | ||||||
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タイトル | structure of a membrane-integrated glycosyltransferase | ||||||
![]() | Chitin synthase 1 | ||||||
![]() | MEMBRANE PROTEIN / glycosyltransferase / TRANSFERASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() chitosome / chitin synthase / chitin synthase activity / : / septum digestion after cytokinesis / cell septum / cell periphery / cell wall organization / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.2 Å | ||||||
![]() | Wu, Y.N. / Zhang, M. / Yang, Y.Z. / Ding, X.Y. / Liu, X.T. / Zhang, M.J. / Yu, H.J. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: structure of a membrane-integrated glycosyltransferase with inhibitor 著者: Wu, Y.N. / Zhang, M. / Yang, Y.Z. / Ding, X.Y. / Liu, X.T. / Zhang, M.J. / Yu, H.J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 292.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 227.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 33423MC ![]() 7xs6C M: このデータのモデリングに利用したマップデータ C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 130001.141 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 株: ATCC 204508 / S288c / 遺伝子: CHS1, YNL192W, N1404 / 発現宿主: ![]() #2: 化合物 | ChemComp-C14 / #3: 化合物 | ChemComp-D12 / #4: 化合物 | ChemComp-HP6 / #5: 化合物 | 研究の焦点であるリガンドがあるか | N | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
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試料調製
構成要素 | 名称: membrane-integrated glycosyltransferase / タイプ: COMPLEX / Entity ID: #1 / 由来: RECOMBINANT |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
由来(組換発現) | 生物種: ![]() |
緩衝液 | pH: 7.4 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES |
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: ![]() |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 3000 nm / 最小 デフォーカス(公称値): 1000 nm |
撮影 | 電子線照射量: 50 e/Å2 / フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) |
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解析
ソフトウェア | 名称: PHENIX / バージョン: 1.19.1_4122: / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||
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CTF補正 | タイプ: PHASE FLIPPING ONLY | ||||||||||||||||||||||||
3次元再構成 | 解像度: 3.2 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 93641 / 対称性のタイプ: POINT | ||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
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