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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7ut4 | ||||||
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タイトル | Gea2 closed/closed conformation (composite structure) | ||||||
![]() | GEA2 isoform 1 | ||||||
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機能・相同性 | ![]() cellular localization / regulation of ARF protein signal transduction / vesicle-mediated transport / guanyl-nucleotide exchange factor activity / ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Muccini, A. / Fromme, J.C. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structural basis for activation of Arf1 at the Golgi complex. 著者: Arnold J Muccini / Margaret A Gustafson / J Christopher Fromme / ![]() 要旨: The Golgi complex is the central sorting station of the eukaryotic secretory pathway. Traffic through the Golgi requires activation of Arf guanosine triphosphatases that orchestrate cargo sorting and ...The Golgi complex is the central sorting station of the eukaryotic secretory pathway. Traffic through the Golgi requires activation of Arf guanosine triphosphatases that orchestrate cargo sorting and vesicle formation by recruiting an array of effector proteins. Arf activation and Golgi membrane association is controlled by large guanine nucleotide exchange factors (GEFs) possessing multiple conserved regulatory domains. Here we present cryoelectron microscopy (cryoEM) structures of full-length Gea2, the yeast paralog of the human Arf-GEF GBF1, that reveal the organization of these regulatory domains and explain how Gea2 binds to the Golgi membrane surface. We find that the GEF domain adopts two different conformations compatible with different stages of the Arf activation reaction. The structure of a Gea2-Arf1 activation intermediate suggests that the movement of the GEF domain primes Arf1 for membrane insertion upon guanosine triphosphate binding. We propose that conformational switching of Gea2 during the nucleotide exchange reaction promotes membrane insertion of Arf1. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 814.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 677.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 165846.844 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() 遺伝子: GEA2, GI527_G0001760 / 発現宿主: ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: ![]() |
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試料調製
構成要素 | 名称: Gea2 / タイプ: COMPLEX / Entity ID: all / 由来: RECOMBINANT |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() ![]() |
由来(組換発現) | 生物種: ![]() ![]() |
緩衝液 | pH: 8 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色![]() ![]() |
急速凍結![]() | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Talos Arctica / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TALOS ARCTICA |
電子銃 | 電子線源![]() ![]() |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD![]() |
撮影 | 電子線照射量: 1 e/Å2 / フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) |
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解析
ソフトウェア | 名称: PHENIX / バージョン: 1.20.1_4487: / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||
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CTF補正![]() | タイプ: NONE | ||||||||||||||||||||||||
3次元再構成![]() | 解像度: 3.9 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 83665 / 対称性のタイプ: POINT | ||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
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