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- PDB-7lgu: Structure of human prestin in the presence of NaCl -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 7lgu
タイトルStructure of human prestin in the presence of NaCl
要素Prestin
キーワードMEMBRANE PROTEIN / transporter family / lipid interaction
機能・相同性
機能・相同性情報


lateral wall of outer hair cell / fructose transmembrane transport / response to salicylic acid / sulfate transmembrane transporter activity / negative regulation of monoatomic ion transmembrane transport / secondary active sulfate transmembrane transporter activity / oxalate transmembrane transporter activity / response to potassium ion / response to auditory stimulus / chloride:bicarbonate antiporter activity ...lateral wall of outer hair cell / fructose transmembrane transport / response to salicylic acid / sulfate transmembrane transporter activity / negative regulation of monoatomic ion transmembrane transport / secondary active sulfate transmembrane transporter activity / oxalate transmembrane transporter activity / response to potassium ion / response to auditory stimulus / chloride:bicarbonate antiporter activity / response to salt / response to thyroid hormone / bicarbonate transport / bicarbonate transmembrane transporter activity / Sensory processing of sound by outer hair cells of the cochlea / positive regulation of cell motility / chloride transport / chloride transmembrane transporter activity / spectrin binding / cochlea development / positive regulation of cell size / lateral plasma membrane / response to ischemia / regulation of membrane potential / sensory perception of sound / regulation of cell shape / basolateral plasma membrane / response to xenobiotic stimulus / protein homodimerization activity
類似検索 - 分子機能
Sulphate anion transporter, conserved site / SLC26A transporters signature. / SLC26A/SulP transporter / SLC26A/SulP transporter domain / Sulfate permease family / STAS domain / STAS domain profile. / STAS domain / STAS domain superfamily
類似検索 - ドメイン・相同性
TETRADECANE / CHOLESTEROL / DECANE / DODECANE / HEXANE / HEPTANE / N-OCTANE / Prestin
類似検索 - 構成要素
生物種Homo sapiens (ヒト)
手法電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.3 Å
データ登録者Ge, J. / Gouaux, E.
資金援助 米国, 1件
組織認可番号国
Howard Hughes Medical Institute (HHMI) 米国
引用ジャーナル: Cell / 年: 2021
タイトル: Molecular mechanism of prestin electromotive signal amplification.
著者: Jingpeng Ge / Johannes Elferich / Sepehr Dehghani-Ghahnaviyeh / Zhiyu Zhao / Marc Meadows / Henrique von Gersdorff / Emad Tajkhorshid / Eric Gouaux /
要旨: Hearing involves two fundamental processes: mechano-electrical transduction and signal amplification. Despite decades of studies, the molecular bases for both remain elusive. Here, we show how ...Hearing involves two fundamental processes: mechano-electrical transduction and signal amplification. Despite decades of studies, the molecular bases for both remain elusive. Here, we show how prestin, the electromotive molecule of outer hair cells (OHCs) that senses both voltage and membrane tension, mediates signal amplification by coupling conformational changes to alterations in membrane surface area. Cryoelectron microscopy (cryo-EM) structures of human prestin bound with chloride or salicylate at a common "anion site" adopt contracted or expanded states, respectively. Prestin is ensconced within a perimeter of well-ordered lipids, through which it induces dramatic deformation in the membrane and couples protein conformational changes to the bulk membrane. Together with computational studies, we illustrate how the anion site is allosterically coupled to changes in the transmembrane domain cross-sectional area and the surrounding membrane. These studies provide insight into OHC electromotility by providing a structure-based mechanism of the membrane motor prestin.
履歴
登録2021年1月21日登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.02021年8月25日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12021年9月15日Group: Database references / カテゴリ: citation / Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first
改定 1.22024年5月29日Group: Data collection / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond

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構造の表示

ムービー
  • 登録構造単位
  • Jmolによる作画
  • ダウンロード
  • EMマップとの重ね合わせ
  • マップデータ: EMDB-23329
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
ムービービューア
構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

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集合体

登録構造単位
A: Prestin
B: Prestin
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)178,876112
ポリマ－164,1282
非ポリマー14,748110
水2,000111
1


  • 登録構造と同一
  • 登録者が定義した集合体
  • 根拠: gel filtration
タイプ名称対称操作数
identity operation1_5551
Buried area47550 Å2
ΔGint506 kcal/mol
Surface area59060 Å2

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要素

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タンパク質 , 1種, 2分子 AB

#1: タンパク質 Prestin / Solute carrier family 26 member 5


分子量: 82064.211 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: SLC26A5, PRES / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P58743

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非ポリマー , 9種, 221分子

#2: 化合物 ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド


分子量: 35.453 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#3: 化合物 ChemComp-CLR / CHOLESTEROL / コレステロ-ル


分子量: 386.654 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C27H46O
#4: 化合物...
ChemComp-OCT / N-OCTANE / オクタン


分子量: 114.229 Da / 分子数: 50 / 由来タイプ: 合成 / 式: C8H18
#5: 化合物...
ChemComp-D10 / DECANE / デカン


分子量: 142.282 Da / 分子数: 36 / 由来タイプ: 合成 / 式: C10H22
#6: 化合物