ChemComp-P3D: (4-{(E)-[(5-AMINOPENTYL)IMINO]METHYL}-5-HYDROXY-6-METHYLPYRIDIN-3...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: P3D
• 名称: 名称: (4-{(E)-[(5-aminopentyl)imino]methyl}-5-hydroxy-6-methylpyridin-3-yl)methyl dihydrogen phosphate; 別称: PHOSPHORIC ACID MONO-{4-[(5-AMINO-PENTYLIMINO)-METHYL]-5-HYDROXY-6-METHYL-PYRIDIN-3-YLMETHYL} ESTER; 日化辞名称: N-[[3-ヒドロキシ-2-メチル-5-[(ホスホノオキシ)メチル]ピリジン-4-イル]メチレン]-1,5-ペンタンジ(以下略)

Chemical information

組成

組成式: C₁₃H₂₂N₃O₅P / 原子数: 44 / 化学式量: 331.305 / 形式電荷: 0

• その他: タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: P3D / 理論座標の詳細: Corina V3.40

履歴

作成	2007年5月16日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2020年6月5日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / 日化辞 / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=P(O)(O)OCc1cnc(c(O)c1/C=N/CCCCCN)C
• CACTVS 3.341: Cc1ncc(CO[P](O)(O)=O)c(C=NCCCCCN)c1O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: Cc1c(c(c(cn1)COP(=O)(O)O)C=NCCCCCN)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: Cc1ncc(CO[P](O)(O)=O)c(C=NCCCCCN)c1O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: Cc1c(c(c(cn1)COP(=O)(O)O)\C=N\CCCCCN)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C13H22N3O5P/c1-10-13(17)12(8-15-6-4-2-3-5-14)11(7-16-10)9-21-22(18,19)20/h7-8,17H,2-6,9,14H2,1H3,(H2,18,19,20)/b15-8+

InChIKey

• InChI 1.03: NPYALNYUWCUSTP-OVCLIPMQSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: (4-{(E)-[(5-aminopentyl)imino]methyl}-5-hydroxy-6-methylpyridin-3-yl)methyl dihydrogen phosphate
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: [4-[(E)-5-aminopentyliminomethyl]-5-hydroxy-6-methyl-pyridin-3-yl]methyl dihydrogen phosphate

PDBエントリ

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PDB-2plk:
Crystal structure of lysine/ornithine decarboxylase complexed with cadaverine from Vibrio vulnificus