ChemComp-OZV: 5'-O-[(R)-hydroxy{[(4R,8S)-4,6,8-trihydroxy-2,4,6,8-tetraoxo-1,3,...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: OZV
• 名称: 名称: 5'-O-[(R)-hydroxy{[(4R,8S)-4,6,8-trihydroxy-2,4,6,8-tetraoxo-1,3,5,7,2lambda~5~,4lambda~5~,6lambda~5~,8lambda~5~-tetroxatetraphosphocan-2-yl]oxy}phosphoryl]adenosine

Chemical information

組成

組成式: C₁₀H₁₆N₅O₁₈P₅ / 原子数: 54 / 化学式量: 649.126 / 形式電荷: 0

その他

6pvw

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: OZV / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 6PVW

履歴

作成	2019年7月22日
公開	2019年11月6日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / PubChem / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: OP4(OP(OP(=O)(OP(O)(=O)OCC3C(C(C(n2c1c(c(N)ncn1)nc2)O3)O)O)OP(O4)(=O)O)(O)=O)=O
• CACTVS 3.385: Nc1ncnc2n(cnc12)[CH]3O[CH](CO[P](O)(=O)O[P]4(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O4)[CH](O)[CH]3O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: c1nc(c2c(n1)n(cn2)C3C(C(C(O3)COP(=O)(O)OP4(=O)OP(=O)(OP(=O)(OP(=O)(O4)O)O)O)O)O)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: Nc1ncnc2n(cnc12)[C@@H]3O[C@H](CO[P](O)(=O)O[P]4(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O4)[C@@H](O)[C@H]3O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: c1nc(c2c(n1)n(cn2)[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)COP(=O)(O)OP4(=O)OP(=O)(OP(=O)(OP(=O)(O4)O)O)O)O)O)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C10H16N5O18P5/c11-8-5-9(13-2-12-8)15(3-14-5)10-7(17)6(16)4(28-10)1-27-34(18,19)31-38(26)32-36(22,23)29-35(20,21)30-37(24,25)33-38/h2-4,6-7,10,16-17H,1H2,(H,18,19)(H,20,21)(H,22,23)(H,24,25)(H2,11,12,13)/t4-,6-,7-,10-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: WWRLCZMRKAWYHG-KQYNXXCUSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 5'-O-[(R)-hydroxy{[(4R,8S)-4,6,8-trihydroxy-2,4,6,8-tetraoxo-1,3,5,7,2lambda~5~,4lambda~5~,6lambda~5~,8lambda~5~-tetroxatetraphosphocan-2-yl]oxy}phosphoryl]adenosine
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl [4,6,8-tris(oxidanyl)-2,4,6,8-tetrakis(oxidanylidene)-1,3,5,7,2$l^{5},4$l^{5},6$l^{5},8$l^{5}-tetraoxatetraphosphocan-2-yl] hydrogen phosphate

PDBエントリ

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PDB-6pvw:
RNase A in complex with cp4pA