ChemComp-ODB: (10S,14S,17R)-14-(3-carbamimidamidopropyl)-3-[[2-(hydroxymethyl)p...

IDまたはキーワード:

登録情報	データベース: PDB化学物質要素 / ID: ODB
名称	名称: (10S,14S,17R)-14-(3-carbamimidamidopropyl)-3-[[2-(hydroxymethyl)phenyl]methyl]-5,12,15-tris(oxidanylidene)-19-thia-3,6,13,16-tetrazatricyclo[19.4.0.0^{6,10}]pentacosa-1(21),22,24-triene-17-carboxamide 別称: P2 macrocycle; (10S,14S,17R)-14-(3-guanidinopropyl)-3-[[2-(hydroxymethyl)phenyl]methyl]-5,12,15-trioxo-19-thia-3,6,13,16-tetrazatricyclo[19.4.0.06,10]pentacosa-1(25),21,23-triene-17-carboxamide

登録情報

データベース: PDB化学物質要素 / ID: ODB

名称

名称: (10S,14S,17R)-14-(3-carbamimidamidopropyl)-3-[[2-(hydroxymethyl)phenyl]methyl]-5,12,15-tris(oxidanylidene)-19-thia-3,6,13,16-tetrazatricyclo[19.4.0.0^{6,10}]pentacosa-1(21),22,24-triene-17-carboxamide
別称: P2 macrocycle; (10S,14S,17R)-14-(3-guanidinopropyl)-3-[[2-(hydroxymethyl)phenyl]methyl]-5,12,15-trioxo-19-thia-3,6,13,16-tetrazatricyclo[19.4.0.06,10]pentacosa-1(25),21,23-triene-17-carboxamide

組成

組成式: C₃₃H₄₆N₈O₅S / 原子数: 93 / 化学式量: 666.834 / 形式電荷: 0

その他

6gwe

タイプ: peptide-like / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: ODB / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 6GWE

履歴

作成	2020年2月27日
公開	2020年3月18日
Modify synonyms	2021年8月28日

外部リンク

UniChem /

ChemSpider /

PubChem /

Wikipedia search /

Google search

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
SMILES

CACTVS 3.385	NC(=N)NCCC[CH]1NC(=O)C[CH]2CCCN2C(=O)CN(Cc3ccccc3CO)Cc4ccccc4CSC[CH](NC1=O)C(N)=O
OpenEye OEToolkits 2.0.7	c1ccc2c(c1)CN(CC(=O)N3CCCC3CC(=O)NC(C(=O)NC(CSC2)C(=O)N)CCCNC(=N)N)Cc4ccccc4CO

-
SMILES CANONICAL

CACTVS 3.385	NC(=N)NCCC[C@@H]1NC(=O)C[C@@H]2CCCN2C(=O)CN(Cc3ccccc3CO)Cc4ccccc4CSC[C@H](NC1=O)C(N)=O
OpenEye OEToolkits 2.0.7	[H]/N=C(/N)\NCCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CSCc2ccccc2CN(CC(=O)N3CCC[C@H]3CC(=O)N1)Cc4ccccc4CO)C(=O)N

-
InChI

InChI 1.03	InChI=1S/C33H46N8O5S/c34-31(45)28-21-47-20-25-10-4-2-8-23(25)17-40(16-22-7-1-3-9-24(22)19-42)18-30(44)41-14-6-11-26(41)15-29(43)38-27(32(46)39-28)12-5-13-37-33(35)36/h1-4,7-10,26-28,42H,5-6,11-21H2,(H2,34,45)(H,38,43)(H,39,46)(H4,35,36,37)/t26-,27-,28-/m0/s1

-
InChIKey

InChI 1.03	IXLKCOMKHVAIOV-KCHLEUMXSA-N

全1件を表示しています

PDB-6gwe:
Crystal structure of Thrombin bound to P2 macrocycle

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
Chemical information

-
構造の表示

-
詳細

-
SMILES

-
SMILES CANONICAL

-
InChI

-
InChIKey

-
PDBエントリ

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-Chemical information

-構造の表示

-詳細

-SMILES

-SMILES CANONICAL

-InChI

-InChIKey

-PDBエントリ

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
Chemical information

-
構造の表示

-
詳細

-
SMILES

-
SMILES CANONICAL

-
InChI

-
InChIKey

-
PDBエントリ

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)