ChemComp-NGF: 3,5-dideoxy-5-[(hydroxyacetyl)amino]-D-glycero-D-galacto-non-2-ul...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: NGF
• 名称: 名称: 3,5-dideoxy-5-[(hydroxyacetyl)amino]-D-glycero-D-galacto-non-2-ulosonic acid; 別称: N-glycolylneuraminic acid, ketone form / 日化辞名称: N-グリコリルノイラミン酸

Chemical information

組成

組成式: C₁₁H₁₉NO₁₀ / 原子数: 41 / 化学式量: 325.269 / 形式電荷: 0

その他

4img

タイプ: D-SACCHARIDE / PDB分類: ATOMS / 3文字コード: NGF / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 4IMG

履歴

作成	2013年1月4日
公開	2013年11月6日
Modify synonyms	2021年3月13日

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詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=C(O)C(=O)CC(O)C(NC(=O)CO)C(O)C(O)C(O)CO
• CACTVS 3.370: OC[CH](O)[CH](O)[CH](O)[CH](NC(=O)CO)[CH](O)CC(=O)C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: C(C(C(C(C(C(CO)O)O)O)NC(=O)CO)O)C(=O)C(=O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](NC(=O)CO)[C@@H](O)CC(=O)C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: C([C@@H]([C@H]([C@H]([C@@H]([C@@H](CO)O)O)O)NC(=O)CO)O)C(=O)C(=O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C11H19NO10/c13-2-6(17)9(19)10(20)8(12-7(18)3-14)4(15)1-5(16)11(21)22/h4,6,8-10,13-15,17,19-20H,1-3H2,(H,12,18)(H,21,22)/t4-,6+,8+,9+,10+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: SUHQNCLNRUAGOO-KQCZLNONSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 3,5-dideoxy-5-[(hydroxyacetyl)amino]-D-glycero-D-galacto-non-2-ulosonic acid
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: (4S,5R,6R,7S,8R)-4,6,7,8,9-pentakis(oxidanyl)-5-(2-oxidanylethanoylamino)-2-oxidanylidene-nonanoic acid

PDBエントリ

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PDB-4img:
Crystal Structure of Pasteurella multocida N-Acetyl-D-Neuraminic acid lyase K164 mutant complexed with N-Glycolylneuraminic acid