ChemComp-ME6: [(2R,3S,5R)-5-(4-azanyl-3-methyl-2-oxo-pyrimidin-3-ium-1-yl)-3-hy...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: ME6
• 名称: 名称: [(2R,3S,5R)-5-(4-azanyl-3-methyl-2-oxo-pyrimidin-3-ium-1-yl)-3-hydroxy-oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate

Chemical information

組成

組成式: C₁₀H₁₇N₃O₇P / 原子数: 38 / 化学式量: 322.232 / 形式電荷: 1

その他

3h8x

DC

タイプ: DNA linking / PDB分類: ATOMN / 3文字コード: ME6 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3H8X / 親要素: DC

履歴

作成	2009年5月21日
記述子を修正	2011年6月4日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• CACTVS 3.352: C[N+]1=C(N)C=CN([CH]2C[CH](O)[CH](CO[P](O)(O)=O)O2)C1=O
• OpenEye OEToolkits 1.6.1: C[N+]1=C(C=CN(C1=O)C2CC(C(O2)COP(=O)(O)O)O)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.352: C[N+]1=C(N)C=CN([C@H]2C[C@H](O)[C@@H](CO[P](O)(O)=O)O2)C1=O
• OpenEye OEToolkits 1.6.1: C[N+]1=C(C=CN(C1=O)[C@H]2C[C@@H]([C@H](O2)COP(=O)(O)O)O)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C10H16N3O7P/c1-12-8(11)2-3-13(10(12)15)9-4-6(14)7(20-9)5-19-21(16,17)18/h2-3,6-7,9,11,14H,4-5H2,1H3,(H2,16,17,18)/p+1/t6-,7+,9+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: SXDBYGVVLMSJDZ-LKEWCRSYSA-O

SYSTEMATIC NAME

• OpenEye OEToolkits 1.6.1: [(2R,3S,5R)-5-(4-azanyl-3-methyl-2-oxo-pyrimidin-3-ium-1-yl)-3-hydroxy-oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate

PDBエントリ

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PDB-8jnr:
Crystal structure of human ALKBH3 bound to 3mC containing ssDNA through distal crosslink