ChemComp-LHA: DOUBLY FUNCTIONALIZED PAROMOMYCIN PM-II-162

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: LHA
• 名称: 名称: doubly functionalized paromomycin pm-ii-162; 別称: (2S)-4-AMINO-N-[(1R,2S,3R,4R,5S)-5-AMINO-4-[(2-AMINO-2-DEOXY-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL)OXY]-3-{[3-O-(2,6-DIAMINO-2,6-DIDEO

BIRD information

• タイプ: アミノグリコシド / 抗菌剤 / 抗寄生虫剤 / 抗生剤
• ダウンロード: Molecular definition / Chemical definition

由来

• Streptomyces rimosus subsp. paromomycinus (バクテリア), :

Chemical information

組成

組成式: C₃₇H₆₅N₇O₁₆ / 原子数: 125 / 化学式量: 863.949 / 形式電荷: 0

• その他: タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: LHA / 理論座標の詳細: Corina V3.40

履歴

作成	2007年6月5日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2020年6月5日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=C(NC5C(O)C(OC3OC(C(OC1OC(CN)C(O)C(O)C1N)C3OCCNCCc2ccccc2)CO)C(OC4OC(CO)C(O)C(O)C4N)C(N)C5)C(O)CCN
• CACTVS 3.341: NCC[CH](O)C(=O)N[CH]1C[CH](N)[CH](O[CH]2O[CH](CO)[CH](O)[CH](O)[CH]2N)[CH](O[CH]3O[CH](CO)[CH](O[CH]4O[CH](CN)[CH](O)[CH](O)[CH]4N)[CH]3OCCNCCc5ccccc5)[CH]1O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: c1ccc(cc1)CCNCCOC2C(C(OC2OC3C(C(CC(C3OC4C(C(C(C(O4)CO)O)O)N)N)NC(=O)C(CCN)O)O)CO)OC5C(C(C(C(O5)CN)O)O)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: NCC[C@H](O)C(=O)N[C@@H]1C[C@H](N)[C@@H](O[C@H]2O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]2N)[C@H](O[C@@H]3O[C@H](CO)[C@@H](O[C@H]4O[C@@H](CN)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]4N)[C@H]3OCCNCCc5ccccc5)[C@H]1O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: c1ccc(cc1)CCNCCO[C@@H]2[C@@H]([C@H](O[C@H]2O[C@@H]3[C@H]([C@@H](C[C@@H]([C@H]3O[C@@H]4[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O4)CO)O)O)N)N)NC(=O)[C@H](CCN)O)O)CO)O[C@@H]5[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@@H](O5)CN)O)O)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C37H65N7O16/c38-8-6-19(47)34(53)44-18-12-17(40)30(58-36-24(42)29(52)27(50)21(14-45)56-36)32(25(18)48)60-37-33(54-11-10-43-9-7-16-4-2-1-3-5-16)31(22(15-46)57-37)59-35-23(41)28(51)26(49)20(13-39)55-35/h1-5,17-33,35-37,43,45-52H,6-15,38-42H2,(H,44,53)/t17-,18+,19-,20-,21+,22+,23+,24+,25-,26+,27+,28+,29+,30+,31+,32+,33+,35+,36+,37-/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: KITFYJSEQIOMTC-AFTVZRPJSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: (2S)-4-amino-N-[(1R,2S,3R,4R,5S)-5-amino-4-[(2-amino-2-deoxy-alpha-D-glucopyranosyl)oxy]-3-{[3-O-(2,6-diamino-2,6-dideoxy-beta-L-idopyranosyl)-2-O-{2-[(2-phenylethyl)amino]ethyl}-beta-D-ribofuranosyl]oxy}-2-hydroxycyclohexyl]-2-hydroxybutanamide
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: (2S)-4-amino-N-[(1R,2S,3R,4R,5S)-5-amino-3-[(2S,3R,4R,5R)-4-[(2R,3R,4R,5S,6S)-3-amino-6-(aminomethyl)-4,5-dihydroxy-oxan-2-yl]oxy-5-(hydroxymethyl)-3-[2-(phenethylamino)ethoxy]oxolan-2-yl]oxy-4-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-amino-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-2-hydroxy-cyclohexyl]-2-hydroxy-butanamide

PDBエントリ

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PDB-2pwt:
Crystal structure of the bacterial ribosomal decoding site complexed with aminoglycoside containing the L-HABA group