ChemComp-KO2: prop-2-en-1-yl D-glycero-alpha-D-talo-oct-2-ulopyranosidonic acid

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: KO2
• 名称: 名称: prop-2-en-1-yl D-glycero-alpha-D-talo-oct-2-ulopyranosidonic acid; 別称: prop-2-en-1-yl D-glycero-alpha-D-talo-oct-2-ulosidonic acid; prop-2-en-1-yl D-glycero-D-talo-oct-2-ulosidonic acid

Chemical information

組成

組成式: C₁₁H₁₈O₉ / 原子数: 38 / 化学式量: 294.255 / 形式電荷: 0

その他

2r2h

KDO

タイプ: D-saccharide, alpha linking / PDB分類: ATOMS / 3文字コード: KO2 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 2R2H / 親要素: KDO

履歴

作成	2008年1月18日
記述子を修正	2011年6月4日
Other modification	2020年7月3日
Modify parent residue	2020年7月17日
Modify synonyms	2020年7月17日
Modify linking type	2020年7月17日
Modify atom id	2020年7月17日
Modify component atom id	2020年7月17日
Modify leaving atom flag	2020年7月17日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / PubChem / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=C(O)C1(OC\C=C)OC(C(O)CO)C(O)C(O)C1O
• CACTVS 3.341: OC[CH](O)[CH]1O[C](OCC=C)([CH](O)[CH](O)[CH]1O)C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C=CCOC1(C(C(C(C(O1)C(CO)O)O)O)O)C(=O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: OC[C@@H](O)[C@H]1O[C@](OCC=C)([C@@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O)C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C=CCO[C@@]1([C@H]([C@H]([C@H]([C@H](O1)[C@@H](CO)O)O)O)O)C(=O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C11H18O9/c1-2-3-19-11(10(17)18)9(16)7(15)6(14)8(20-11)5(13)4-12/h2,5-9,12-16H,1,3-4H2,(H,17,18)/t5-,6-,7+,8-,9+,11-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: MJWRJGHIYDIAQR-RUEXUQCSSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: prop-2-en-1-yl D-glycero-alpha-D-talo-oct-2-ulopyranosidonic acid
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: (2R,3S,4S,5R,6R)-6-[(1R)-1,2-dihydroxyethyl]-3,4,5-trihydroxy-2-prop-2-enoxy-oxane-2-carboxylic acid

PDBエントリ

全4件を表示しています

PDB-2r2h:
Structure of S25-2 in Complex with Ko

PDB-3ijh:
Structure of S67-27 in Complex with Ko

PDB-3oke:
Crystal structure of S25-39 in complex with Ko

PDB-6usc:
Structure of Human Intelectin-1 in complex with KO