ChemComp-JW5: 6-(HYDROXYMETHYL)URIDINE 5'-(DIHYDROGEN PHOSPHATE)

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: JW5
• 名称: 名称: 6-(hydroxymethyl)uridine 5'-(dihydrogen phosphate)

Chemical information

組成

組成式: C₁₀H₁₅N₂O₁₀P / 原子数: 38 / 化学式量: 354.207 / 形式電荷: 0

• その他: タイプ: RNA LINKING / PDB分類: ATOMN / 1文字コード: N / 3文字コード: JW5 / 理論座標の詳細: Corina

履歴

作成	2007年6月29日
記述子を修正	2011年6月4日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / PubChem / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=C1NC(=O)N(C(=C1)CO)C2OC(C(O)C2O)COP(=O)(O)O
• CACTVS 3.341: OCC1=CC(=O)NC(=O)N1[CH]2O[CH](CO[P](O)(O)=O)[CH](O)[CH]2O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1=C(N(C(=O)NC1=O)C2C(C(C(O2)COP(=O)(O)O)O)O)CO

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: OCC1=CC(=O)NC(=O)N1[C@@H]2O[C@H](CO[P](O)(O)=O)[C@@H](O)[C@H]2O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1=C(N(C(=O)NC1=O)[C@H]2[C@@H]([C@@H]([C@H](O2)COP(=O)(O)O)O)O)CO

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C10H15N2O10P/c13-2-4-1-6(14)11-10(17)12(4)9-8(16)7(15)5(22-9)3-21-23(18,19)20/h1,5,7-9,13,15-16H,2-3H2,(H,11,14,17)(H2,18,19,20)/t5-,7-,8-,9-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: MSQUFEPNTQRBDI-ZOQUXTDFSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: 6-(hydroxymethyl)uridine 5'-(dihydrogen phosphate)
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: [(2R,3S,4R,5R)-3,4-dihydroxy-5-[6-(hydroxymethyl)-2,4-dioxo-pyrimidin-1-yl]oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate

PDBエントリ

全1件を表示しています

PDB-2qcm:
Crystal structure of the orotidine-5'-monophosphate decarboxylase domain (Asp312Asn mutant) of human UMP synthase bound to 6-hydroxymethyl-UMP