ChemComp-JS6: (1R,2R,3S,4R,6S)-4,6-diamino-2-{[3-O-(2,6-diamino-2,6-dideoxy-bet...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: JS6
• 名称: 名称: (1R,2R,3S,4R,6S)-4,6-diamino-2-{[3-O-(2,6-diamino-2,6-dideoxy-beta-L-idopyranosyl)-2-O-{2-[(2-phenylethyl)amino]ethyl}-beta-D-ribofuranosyl]oxy}-3-hydroxycyclohexyl 2-amino-2-deoxy-alpha-D-glucopyranoside

Chemical information

組成

組成式: C₃₃H₅₈N₆O₁₄ / 原子数: 111 / 化学式量: 762.845 / 形式電荷: 0

その他

3s4p

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAD / 3文字コード: JS6 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3S4P

履歴

作成	2011年6月1日
aromatic_flag"を修正	2011年6月4日
記述子を修正	2011年6月4日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / ChEMBL / PubChem / PubChem_TPharma / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O(C2C(OC1OC(CO)C(O)C(O)C1N)C(N)CC(N)C2O)C5OC(C(OC3OC(CN)C(O)C(O)C3N)C5OCCNCCc4ccccc4)CO
• CACTVS 3.370: NC[CH]1O[CH](O[CH]2[CH](CO)O[CH](O[CH]3[CH](O)[CH](N)C[CH](N)[CH]3O[CH]4O[CH](CO)[CH](O)[CH](O)[CH]4N)[CH]2OCCNCCc5ccccc5)[CH](N)[CH](O)[CH]1O
• OpenEye OEToolkits 1.7.2: c1ccc(cc1)CCNCCOC2C(C(OC2OC3C(C(CC(C3OC4C(C(C(C(O4)CO)O)O)N)N)N)O)CO)OC5C(C(C(C(O5)CN)O)O)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: NC[C@@H]1O[C@H](O[C@@H]2[C@@H](CO)O[C@@H](O[C@@H]3[C@@H](O)[C@H](N)C[C@H](N)[C@H]3O[C@H]4O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]4N)[C@@H]2OCCNCCc5ccccc5)[C@H](N)[C@@H](O)[C@@H]1O
• OpenEye OEToolkits 1.7.2: c1ccc(cc1)CCNCCO[C@@H]2[C@@H]([C@H](O[C@H]2O[C@@H]3[C@H]([C@@H](C[C@@H]([C@H]3O[C@@H]4[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O4)CO)O)O)N)N)N)O)CO)O[C@@H]5[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@@H](O5)CN)O)O)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C33H58N6O14/c34-11-17-23(43)25(45)20(37)31(48-17)52-28-19(13-41)50-33(30(28)47-9-8-39-7-6-14-4-2-1-3-5-14)53-29-22(42)15(35)10-16(36)27(29)51-32-21(38)26(46)24(44)18(12-40)49-32/h1-5,15-33,39-46H,6-13,34-38H2/t15-,16+,17+,18-,19-,20-,21-,22+,23-,24-,25-,26-,27-,28-,29-,30-,31-,32-,33+/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: RYWOYAQAVIFICV-KWRLVFCDSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: (1R,2R,3S,4R,6S)-4,6-diamino-2-{[3-O-(2,6-diamino-2,6-dideoxy-beta-L-idopyranosyl)-2-O-{2-[(2-phenylethyl)amino]ethyl}-beta-D-ribofuranosyl]oxy}-3-hydroxycyclohexyl 2-amino-2-deoxy-alpha-D-glucopyranoside
• OpenEye OEToolkits 1.7.2: (2S,3S,4R,5R,6R)-2-(aminomethyl)-5-azanyl-6-[(2R,3R,4R,5S)-5-[(1R,2R,3S,5R,6S)-3,5-bis(azanyl)-2-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-azanyl-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-6-oxidanyl-cyclohexyl]oxy-2-(hydroxymethyl)-4-[2-(phenethylamino)ethoxy]oxolan-3-yl]oxy-oxane-3,4-diol

PDBエントリ

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PDB-3s4p:
Crystal structure of the bacterial ribosomal decoding site complexed with an amphiphilic paromomycin O2''-ether analogue