ChemComp-JS5: (2S,3S,4R,5R,6R)-5-AMINO-2-(AMINOMETHYL)-6-((2R,3R,4R,5S)-5-((1R,...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: JS5
• 名称: 名称: (2S,3S,4R,5R,6R)-5-amino-2-(aminomethyl)-6-((2R,3R,4R,5S)-5-((1R,2R,3S,5R,6S)-3,5-diamino-2-((2S,3R,4R,5S,6R)-3-amino-4; 別称: 2"-O-[N-(3-(AMINOMETHYL)-PYRIDINE)-2-AMINOETHYL]PAROMOMYCIN

BIRD information

• タイプ: アミノグリコシド / 抗菌剤 / 抗寄生虫剤 / 抗生剤
• ダウンロード: Molecular definition / Chemical definition

由来

• Streptomyces rimosus subsp. paromomycinus (バクテリア), :

Chemical information

組成

組成式: C₃₁H₆₁N₇O₁₄ / 原子数: 113 / 化学式量: 755.855 / 形式電荷: 0

その他

2be0

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAD / 3文字コード: JS5 / モデル座標のPDB-ID: 2BE0

履歴

作成	2005年11月9日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2020年6月5日

• 外部リンク: UniChem / ChEMBL / DrugBank / PubChem / PubChem_TPharma / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O(C2C(OC1OC(CO)C(O)C(O)C1N)C(N)CC(N)C2O)C5OC(C(OC3OC(CN)C(O)C(O)C3N)C5OCCNCC4CCCNC4)CO
• CACTVS 3.341: NC[CH]1O[CH](O[CH]2[CH](CO)O[CH](O[CH]3[CH](O)[CH](N)C[CH](N)[CH]3O[CH]4O[CH](CO)[CH](O)[CH](O)[CH]4N)[CH]2OCCNC[CH]5CCCNC5)[CH](N)[CH](O)[CH]1O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1CC(CNC1)CNCCOC2C(C(OC2OC3C(C(CC(C3OC4C(C(C(C(O4)CO)O)O)N)N)N)O)CO)OC5C(C(C(C(O5)CN)O)O)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: NC[C@@H]1O[C@H](O[C@@H]2[C@@H](CO)O[C@@H](O[C@@H]3[C@@H](O)[C@H](N)C[C@H](N)[C@H]3O[C@H]4O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]4N)[C@@H]2OCCNC[C@@H]5CCCNC5)[C@H](N)[C@@H](O)[C@@H]1O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1CC(CNC1)CNCCO[C@@H]2[C@@H]([C@H](O[C@H]2O[C@@H]3[C@H]([C@@H](C[C@@H]([C@H]3O[C@@H]4[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O4)CO)O)O)N)N)N)O)CO)O[C@@H]5[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@@H](O5)CN)O)O)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C31H61N7O14/c32-7-15-21(42)23(44)18(35)29(47-15)51-26-17(11-40)49-31(28(26)46-5-4-38-9-12-2-1-3-37-8-12)52-27-20(41)13(33)6-14(34)25(27)50-30-19(36)24(45)22(43)16(10-39)48-30/h12-31,37-45H,1-11,32-36H2/t12?,13-,14+,15+,16-,17-,18-,19-,20+,21-,22-,23-,24-,25-,26-,27-,28-,29-,30-,31+/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: AHJDGUQMOYBKDU-NSCPTEJBSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: (1R,2R,3S,4R,6S)-4,6-diamino-2-{[3-O-(2,6-diamino-2,6-dideoxy-beta-L-idopyranosyl)-2-O-(2-{[(3R)-piperidin-3-ylmethyl]amino}ethyl)-beta-D-ribofuranosyl]oxy}-3-hydroxycyclohexyl 2-amino-2-deoxy-alpha-D-glucopyranoside
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: (2R,3S,4R,5R,6S)-5-amino-6-[(1R,2R,3S,4R,6S)-4,6-diamino-2-[(2S,3R,4R,5R)-4-[(2R,3R,4R,5S,6S)-3-amino-6-(aminomethyl)-4,5-dihydroxy-oxan-2-yl]oxy-5-(hydroxymethyl)-3-[2-(piperidin-3-ylmethylamino)ethoxy]oxolan-2-yl]oxy-3-hydroxy-cyclohexyl]oxy-2-(hydroxymethyl)oxane-3,4-diol

PDBエントリ

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PDB-2be0:
Complex Between Paromomycin Derivative JS5-39 and the 16S-Rrna A-Site.