ChemComp-JS4: (2S,3S,4R,5R,6R)-5-AMINO-2-(AMINOMETHYL)-6-((2R,3R,4R,5S)-4-(2-(3...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: JS4
• 名称: 名称: (2S,3S,4R,5R,6R)-5-amino-2-(aminomethyl)-6-((2R,3R,4R,5S)-4-(2-(3-aminopropylamino)ethoxy)-5-((1R,2R,3S,5R,6S)-3,5-diam; 別称: 2"-O-[N-(3-(AMINOPROPYL)2-AMINOETHYL]PAROMOMYCIN

BIRD information

• タイプ: アミノグリコシド / 抗菌剤 / 抗寄生虫剤 / 抗生剤
• ダウンロード: Molecular definition / Chemical definition

由来

• Streptomyces rimosus subsp. paromomycinus (バクテリア), :

Chemical information

組成

組成式: C₂₈H₅₇N₇O₁₄ / 原子数: 106 / 化学式量: 715.791 / 形式電荷: 0

その他

2bee

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: JS4 / モデル座標のPDB-ID: 2BEE

履歴

作成	2005年11月16日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2020年6月5日

• 外部リンク: UniChem / ChEMBL / DrugBank / PubChem / PubChem_TPharma / ZINC / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O(C2C(OC1OC(CO)C(O)C(O)C1N)C(N)CC(N)C2O)C4OC(C(OC3OC(CN)C(O)C(O)C3N)C4OCCNCCCN)CO
• CACTVS 3.341: NCCCNCCO[CH]1[CH](O[CH](CO)[CH]1O[CH]2O[CH](CN)[CH](O)[CH](O)[CH]2N)O[CH]3[CH](O)[CH](N)C[CH](N)[CH]3O[CH]4O[CH](CO)[CH](O)[CH](O)[CH]4N
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1C(C(C(C(C1N)OC2C(C(C(C(O2)CO)O)O)N)OC3C(C(C(O3)CO)OC4C(C(C(C(O4)CN)O)O)N)OCCNCCCN)O)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: NCCCNCCO[C@H]1[C@@H](O[C@H](CO)[C@H]1O[C@H]2O[C@@H](CN)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]2N)O[C@@H]3[C@@H](O)[C@H](N)C[C@H](N)[C@H]3O[C@H]4O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]4N
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1[C@H]([C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H]1N)O[C@@H]2[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O2)CO)O)O)N)O[C@H]3[C@@H](C([C@H](O3)CO)O[C@@H]4[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@@H](O4)CN)O)O)N)OCCNCCCN)O)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C28H57N7O14/c29-2-1-3-35-4-5-43-25-23(48-26-15(33)20(41)18(39)12(7-30)44-26)14(9-37)46-28(25)49-24-17(38)10(31)6-11(32)22(24)47-27-16(34)21(42)19(40)13(8-36)45-27/h10-28,35-42H,1-9,29-34H2/t10-,11+,12+,13-,14-,15-,16-,17+,18-,19-,20-,21-,22-,23-,24-,25-,26-,27-,28+/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: FJVLHNJZMYGVLT-XXJRHLBLSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: (1R,2R,3S,4R,6S)-4,6-diamino-2-{[2-O-{2-[(3-aminopropyl)amino]ethyl}-3-O-(2,6-diamino-2,6-dideoxy-beta-L-idopyranosyl)-beta-D-ribofuranosyl]oxy}-3-hydroxycyclohexyl 2-amino-2-deoxy-alpha-D-glucopyranoside
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: (2R,3S,4R,5R,6S)-5-amino-6-[(1R,2R,3S,4R,6S)-4,6-diamino-2-[(2S,3R,5R)-4-[(2R,3R,4R,5S,6S)-3-amino-6-(aminomethyl)-4,5-dihydroxy-oxan-2-yl]oxy-3-[2-(3-aminopropylamino)ethoxy]-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]oxy-3-hydroxy-cyclohexyl]oxy-2-(hydroxymethyl)oxane-3,4-diol

PDBエントリ

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PDB-2bee:
Complex Between Paromomycin derivative JS4 and the 16S-Rrna A Site