ChemComp-J42: N-{[(1S)-5-({[4-bromo-2-({4,44-dioxo-48-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahy...

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登録情報	データベース: PDB化学物質要素 / ID: J42
名称	名称: N-{[(1S)-5-({[4-bromo-2-({4,44-dioxo-48-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40-dodecaoxa-3,43-diazaoctatetracont-1-yl}oxy)phenyl] ...名称: N-{[(1S)-5-({[4-bromo-2-({4,44-dioxo-48-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40-dodecaoxa-3,43-diazaoctatetracont-1-yl}oxy)phenyl]carbamoyl}amino)-1-carboxypentyl]carbamoyl}-L-glutamic acid

登録情報

データベース: PDB化学物質要素 / ID: J42

名称

名称: N-{[(1S)-5-({[4-bromo-2-({4,44-dioxo-48-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40-dodecaoxa-3,43-diazaoctatetracont-1-yl}oxy)phenyl] ...

組成

組成式: C₅₈H₉₇BrN₈O₂₄S / 原子数: 189 / 化学式量: 1402.399 / 形式電荷: 0

その他

4ngt

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: J42 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 4NGT

履歴

作成	2013年12月12日
公開	2014年6月18日

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構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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SMILES

ACDLabs 12.01	O=C(O)C(NC(=O)NC(C(=O)O)CCCCNC(=O)Nc3ccc(Br)cc3OCCNC(=O)CCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCNC(=O)CCCCC1SCC2NC(=O)NC12)CCC(=O)O
CACTVS 3.385	OC(=O)CC[CH](NC(=O)N[CH](CCCCNC(=O)Nc1ccc(Br)cc1OCCNC(=O)CCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCNC(=O)CCCC[CH]2SC[CH]3NC(=O)N[CH]23)C(O)=O)C(O)=O
OpenEye OEToolkits 1.7.6	c1cc(c(cc1Br)OCCNC(=O)CCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCNC(=O)CCCCC2C3C(CS2)NC(=O)N3)NC(=O)NCCCCC(C(=O)O)NC(=O)NC(CCC(=O)O)C(=O)O

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SMILES CANONICAL

CACTVS 3.385	OC(=O)CC[C@H](NC(=O)N[C@@H](CCCCNC(=O)Nc1ccc(Br)cc1OCCNC(=O)CCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCNC(=O)CCCC[C@@H]2SC[C@@H]3NC(=O)N[C@H]23)C(O)=O)C(O)=O
OpenEye OEToolkits 1.7.6	c1cc(c(cc1Br)OCCNC(=O)CCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCOCCNC(=O)CCCC[C@H]2[C@@H]3[C@H](CS2)NC(=O)N3)NC(=O)NCCCC[C@@H](C(=O)O)NC(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O

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InChI

InChI 1.03	InChI=1S/C58H97BrN8O24S/c59-43-8-9-44(63-56(76)62-13-4-3-5-45(54(72)73)64-57(77)65-46(55(74)75)10-11-52(70)71)48(41-43)91-18-15-61-51(69)12-16-79-19-21-81-23-25-83-27-29-85-31-33-87-35-37-89-39-40-90-38-36-88-34-32-86-30-28-84-26-24-82-22-20-80-17-14-60-50(68)7-2-1-6-49-53-47(42-92-49)66-58(78)67-53/h8-9,41,45-47,49,53H,1-7,10-40,42H2,(H,60,68)(H,61,69)(H,70,71)(H,72,73)(H,74,75)(H2,62,63,76)(H2,64,65,77)(H2,66,67,78)/t45-,46-,47-,49-,53-/m0/s1

InChI 1.03

InChI=1S/C58H97BrN8O24S/c59-43-8-9-44(63-56(76)62-13-4-3-5-45(54(72)73)64-57(77)65-46(55(74)75)10-11-52(70)71)48(41-43)91-18-15-61-51(69)12-16-79-19-21-81-23-25-83-27-29-85-31-33-87-35-37-89-39-40-90-38-36-88-34-32-86-30-28-84-26-24-82-22-20-80-17-14-60-50(68)7-2-1-6-49-53-47(42-92-49)66-58(78)67-53/h8-9,41,45-47,49,53H,1-7,10-40,42H2,(H,60,68)(H,61,69)(H,70,71)(H,72,73)(H,74,75)(H2,62,63,76)(H2,64,65,77)(H2,66,67,78)/t45-,46-,47-,49-,53-/m0/s1

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InChIKey

InChI 1.03	GEHJWUZNJRAVQB-HJXABITDSA-N

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SYSTEMATIC NAME

ACDLabs 12.01	N-{[(1S)-5-({[4-bromo-2-({4,44-dioxo-48-[(3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-7,10,13,16,19,22,25,28,31,34,37,40-dodecaoxa-3,43-diazaoctatetracont-1-yl}oxy)phenyl]carbamoyl}amino)-1-carboxypentyl]carbamoyl}-L-glutamic acid
OpenEye OEToolkits 1.7.6	(2S)-2-[[(2S)-6-[[2-[2-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxidanylidene-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]propanoylamino]ethoxy]-4-bromanyl-phenyl]carbamoylamino]-1-oxidanyl-1-oxidanylidene-hexan-2-yl]carbamoylamino]pentanedioic acid

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PDB-4ngt:
Crystal Structure of Glutamate Carboxypeptidase II in a complex with urea-based inhibitor

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