ChemComp-IOO: N7-(3,4-difluorobenzyl) guanosine 5'-monophosphate

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: IOO
• 名称: 名称: N7-(3,4-difluorobenzyl) guanosine 5'-monophosphate; 別称: [(2R,3S,4R,5R)-5-[2-azanyl-7-[[3,4-bis(fluoranyl)phenyl]methyl]-6-oxidanylidene-1H-purin-7-ium-9-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate

Chemical information

組成

組成式: C₁₇H₁₉F₂N₅O₈P / 原子数: 52 / 化学式量: 490.332 / 形式電荷: 1

その他

7zeg

G

タイプ: L-RNA linking / PDB分類: ATOMN / 3文字コード: IOO / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 7ZEG / 親要素: G

履歴

作成	2022年4月4日
Modify linking type	2022年4月5日
公開	2022年4月13日
記述子を修正	2022年8月22日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / PubChem / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• CACTVS 3.385: NC1=Nc2n(c[n+](Cc3ccc(F)c(F)c3)c2C(=O)N1)[CH]4O[CH](CO[P](O)(O)=O)[CH](O)[CH]4O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: c1cc(c(cc1C[n+]2cn(c3c2C(=O)NC(=N3)N)C4C(C(C(O4)COP(=O)(O)O)O)O)F)F

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: NC1=Nc2n(c[n+](Cc3ccc(F)c(F)c3)c2C(=O)N1)[C@@H]4O[C@H](CO[P](O)(O)=O)[C@@H](O)[C@H]4O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: c1cc(c(cc1C[n+]2cn(c3c2C(=O)NC(=N3)N)[C@H]4[C@@H]([C@@H]([C@H](O4)COP(=O)(O)O)O)O)F)F

InChI

• InChI 1.06: InChI=1S/C17H18F2N5O8P/c18-8-2-1-7(3-9(8)19)4-23-6-24(14-11(23)15(27)22-17(20)21-14)16-13(26)12(25)10(32-16)5-31-33(28,29)30/h1-3,6,10,12-13,16,25-26H,4-5H2,(H4-,20,21,22,27,28,29,30)/p+1/t10-,12-,13-,16-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.06: BIHPVAUGYOUOAQ-XNIJJKJLSA-O

PDBエントリ

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PDB-7zeg:
Human cytosolic 5' nucleotidase IIIB in complex with 3,4-diF-Bn7GMP