ChemComp-HXZ: 4'-ethylthymidine 5'-(tetrahydrogen triphosphate)

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: HXZ
• 名称: 名称: 4'-ethylthymidine 5'-(tetrahydrogen triphosphate); 日化辞名称: 4′-エチルチミジン5′-三りん酸

Chemical information

組成

組成式: C₁₂H₂₁N₂O₁₄P₃ / 原子数: 52 / 化学式量: 510.221 / 形式電荷: 0

その他

3m8r

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: HXZ / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3M8R

履歴

作成	2010年3月31日
記述子を修正	2011年6月4日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / 日化辞 / PubChem / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=P(O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC2(OC(N1C(=O)NC(=O)C(=C1)C)CC2O)CC
• CACTVS 3.370: CC[C]1(CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)O[CH](C[CH]1O)N2C=C(C)C(=O)NC2=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.0: CCC1(C(CC(O1)N2C=C(C(=O)NC2=O)C)O)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: CC[C@]1(CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)O[C@H](C[C@@H]1O)N2C=C(C)C(=O)NC2=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.0: CC[C@]1([C@H](C[C@@H](O1)N2C=C(C(=O)NC2=O)C)O)CO[P@](=O)(O)O[P@@](=O)(O)OP(=O)(O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C12H21N2O14P3/c1-3-12(6-25-30(21,22)28-31(23,24)27-29(18,19)20)8(15)4-9(26-12)14-5-7(2)10(16)13-11(14)17/h5,8-9,15H,3-4,6H2,1-2H3,(H,21,22)(H,23,24)(H,13,16,17)(H2,18,19,20)/t8-,9+,12+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: RICQFQMPHJAPNN-YGOYTEALSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 4'-ethylthymidine 5'-(tetrahydrogen triphosphate)
• OpenEye OEToolkits 1.7.0: [[(2R,3S,5R)-2-ethyl-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxo-pyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate

PDBエントリ

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PDB-3m8r:
Crystal structure of the large fragment of DNA polymerase I from Thermus aquaticus in a closed ternary complex with trapped 4'-ethylated dTTP