ChemComp-HFD: 2-fluoro-9-{5-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: HFD
• 名称: 名称: 2-fluoro-9-{5-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-D-arabinofuranosyl}-9H-purin-6-a; 別称: Fludarabine-TRIPHOSPHATE / 日化辞名称: Fara-ATP

Chemical information

組成

組成式: C₁₀H₁₅FN₅O₁₃P₃ / 原子数: 47 / 化学式量: 525.171 / 形式電荷: 0

その他

6dwk

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: HFD / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 6DWK

履歴

作成	2018年6月27日
Modify synonyms	2018年6月27日
公開	2018年10月10日
Modify synonyms	2020年6月5日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / ChEMBL / 日化辞 / PubChem / SureChEMBL / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=P(OCC1OC(C(C1O)O)n3c2c(c(nc(n2)F)N)nc3)(O)OP(OP(O)(O)=O)(O)=O
• CACTVS 3.385: Nc1nc(F)nc2n(cnc12)[CH]3O[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)[CH](O)[CH]3O
• OpenEye OEToolkits 2.0.6: c1nc2c(nc(nc2n1C3C(C(C(O3)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O)O)F)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: Nc1nc(F)nc2n(cnc12)[C@@H]3O[C@H](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)[C@@H](O)[C@@H]3O
• OpenEye OEToolkits 2.0.6: c1nc2c(nc(nc2n1[C@H]3[C@H]([C@@H]([C@H](O3)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O)O)F)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C10H15FN5O13P3/c11-10-14-7(12)4-8(15-10)16(2-13-4)9-6(18)5(17)3(27-9)1-26-31(22,23)29-32(24,25)28-30(19,20)21/h2-3,5-6,9,17-18H,1H2,(H,22,23)(H,24,25)(H2,12,14,15)(H2,19,20,21)/t3-,5-,6+,9-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: PIOKUWLZUXUBCO-FJFJXFQQSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 2-fluoro-9-{5-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-D-arabinofuranosyl}-9H-purin-6-amine
• OpenEye OEToolkits 2.0.6: [[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{R})-5-(6-azanyl-2-fluoranyl-purin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate

PDBエントリ

全2件を表示しています

PDB-6dwk:
SAMHD1 Bound to Fludarabine-TP in the Catalytic Pocket

PDB-6r4u:
Crystal structure of the Pri1 subunit of human primase bound to fludarabine triphosphate