ChemComp-GP2: PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANOSYL ESTER

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: GP2
• 名称: 名称: phosphomethylphosphonic acid guanosyl ester; 日化辞名称: グアノシン5′-[α,β-メチレン]二りん酸

Chemical information

組成

組成式: C₁₁H₁₇N₅O₁₀P₂ / 原子数: 45 / 化学式量: 441.228 / 形式電荷: 0

その他

1s1d

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: GP2 / モデル座標のPDB-ID: 1S1D

履歴

作成	2004年1月14日
記述子を修正	2011年6月4日

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詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=P(O)(O)CP(=O)(O)OCC3OC(n2cnc1c2N=C(N)NC1=O)C(O)C3O
• CACTVS 3.341: NC1=Nc2n(cnc2C(=O)N1)[CH]3O[CH](CO[P](O)(=O)C[P](O)(O)=O)[CH](O)[CH]3O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: c1nc2c(n1C3C(C(C(O3)COP(=O)(CP(=O)(O)O)O)O)O)N=C(NC2=O)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: NC1=Nc2n(cnc2C(=O)N1)[C@@H]3O[C@H](CO[P@](O)(=O)C[P](O)(O)=O)[C@@H](O)[C@H]3O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: c1nc2c(n1[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)CO[P@](=O)(CP(=O)(O)O)O)O)O)N=C(NC2=O)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C11H17N5O10P2/c12-11-14-8-5(9(19)15-11)13-2-16(8)10-7(18)6(17)4(26-10)1-25-28(23,24)3-27(20,21)22/h2,4,6-7,10,17-18H,1,3H2,(H,23,24)(H2,20,21,22)(H3,12,14,15,19)/t4-,6-,7-,10-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: OCJWYBKRHNXUME-KQYNXXCUSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: 5'-O-[(S)-hydroxy(phosphonomethyl)phosphoryl]guanosine
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: [[(2R,3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl]methylphosphonic acid

PDBエントリ

全3件を表示しています

PDB-1s1d:
Structure and protein design of human apyrase

PDB-3exm:
Crystal structure of the phosphatase SC4828 with the non-hydrolyzable nucleotide GPCP

PDB-7ojz:
SaFtsZ complexed with GMPCP