ChemComp-GMT: (2S)-2-{[2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranosyl]oxy}butanedio...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: GMT
• 名称: 名称: (2S)-2-{[2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranosyl]oxy}butanedioic acid; 別称: (2S)-2-{[2-(acetylamino)-2-deoxy-alpha-D-glucopyranosyl]oxy}butanedioic acid;; 日化辞名称: (2S)-2-[2-(アセチルアミノ)-2-デオキシ-α-D-グルコピラノシルオキシ]ブタン二酸

Chemical information

組成

組成式: C₁₂H₁₉NO₁₀ / 原子数: 42 / 化学式量: 337.28 / 形式電荷: 0

その他

5d00

NDG

タイプ: D-saccharide / PDB分類: ATOMS / 3文字コード: GMT / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 5D00 / 親要素: NDG

履歴

作成	2015年8月6日
公開	2016年9月7日
Other modification	2020年7月3日
Modify parent residue	2020年7月17日
Modify name	2020年7月17日
Modify synonyms	2020年7月17日
Modify internal type	2020年7月17日
Modify linking type	2020年7月17日
Modify atom id	2020年7月17日
Modify component atom id	2020年7月17日
Modify leaving atom flag	2020年7月17日

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詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=C(O)CC(C(O)=O)OC1C(C(C(C(O1)CO)O)O)NC(C)=O
• CACTVS 3.385: CC(=O)N[CH]1[CH](O)[CH](O)[CH](CO)O[CH]1O[CH](CC(O)=O)C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 1.9.2: CC(=O)NC1C(C(C(OC1OC(CC(=O)O)C(=O)O)CO)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: CC(=O)N[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 1.9.2: CC(=O)N[C@@H]1[C@H]([C@@H]([C@H](O[C@@H]1O[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)CO)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C12H19NO10/c1-4(15)13-8-10(19)9(18)6(3-14)23-12(8)22-5(11(20)21)2-7(16)17/h5-6,8-10,12,14,18-19H,2-3H2,1H3,(H,13,15)(H,16,17)(H,20,21)/t5-,6+,8+,9+,10+,12-/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: COBMRTSHZAUOCY-BVKYVCSXSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: (2S)-2-{[2-(acetylamino)-2-deoxy-alpha-D-glucopyranosyl]oxy}butanedioic acid
• OpenEye OEToolkits 1.9.2: (2S)-2-[(2R,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxybutanedioic acid

PDBエントリ

全2件を表示しています

PDB-5d00:
Crystal structure of BshA from B. subtilis complexed with N-acetylglucosaminyl-malate and UMP

PDB-5d01:
Crystal structure of BshA from B. subtilis complexed with N-acetylglucosaminyl-malate