ChemComp-GCQ: GEMCITABINE DIPHOSPHATE

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: GCQ
• 名称: 名称: gemcitabine diphosphate; 別称: ((2R,3R,5R)-5-(4-AMINO-2-OXOPYRIMIDIN-1(2H)-YL)-4,4-DIFLUORO-3-HYDROXYTETRAHYDROFURAN-2-YL)METHYL TRIHYDROGEN

Chemical information

組成

組成式: C₉H₁₃F₂N₃O₁₀P₂ / 原子数: 39 / 化学式量: 423.158 / 形式電荷: 0

その他

2eud

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: GCQ / モデル座標のPDB-ID: 2EUD

履歴

作成	2005年11月22日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2020年6月5日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / CompTox / HMDB / PubChem / SureChEMBL / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=P(O)(O)OP(=O)(O)OCC2OC(N1C(=O)N=C(N)C=C1)C(F)(F)C2O
• CACTVS 3.341: NC1=NC(=O)N(C=C1)[CH]2O[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)[CH](O)C2(F)F
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1=CN(C(=O)N=C1N)C2C(C(C(O2)COP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O)(F)F

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: NC1=NC(=O)N(C=C1)[C@@H]2O[C@H](CO[P@@](O)(=O)O[P](O)(O)=O)[C@@H](O)C2(F)F
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1=CN(C(=O)N=C1N)[C@H]2C([C@@H]([C@H](O2)CO[P@](=O)(O)OP(=O)(O)O)O)(F)F

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C9H13F2N3O10P2/c10-9(11)6(15)4(3-22-26(20,21)24-25(17,18)19)23-7(9)14-2-1-5(12)13-8(14)16/h1-2,4,6-7,15H,3H2,(H,20,21)(H2,12,13,16)(H2,17,18,19)/t4-,6-,7-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: FRQISCZGNNXEMD-QPPQHZFASA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: 2'-deoxy-2',2'-difluorocytidine 5'-(trihydrogen diphosphate)
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: [(2R,3R,5R)-5-(4-amino-2-oxo-pyrimidin-1-yl)-4,4-difluoro-3-hydroxy-oxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate

PDBエントリ

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PDB-2eud:
Structures of Yeast Ribonucleotide Reductase I complexed with Ligands and Subunit Peptides